著者

車谷 奈都実 大川 剛直

雑誌

研究報告バイオ情報学(BIO)

巻号頁・発行日

vol.2012, no.14, pp.1-6, 2012-06-21

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蛋白質の機能と構造の関連を明らかにする上で,その立体構造を比較し,局所的に類似した部分を見つけることが重要である.本研究では蛋白質分子表面データを3次元画像へ変換し,そこから局所特徴点を検出して特徴量を算出することにより,蛋白質の局所構造間を比較する手法を提案する.提案手法を蛋白質の結合部位予測へ適用した結果,11 個中 6 個の結合部位の予測に成功することが示されており,その有効性を確認した.To explain the relationships between functions and structures of proteins, it is important to identify locally similar sites on protein molecular surfaces by comparing protein 3D structures. In this paper, we propose a method of comparing protein structures, in which the molecular surfaces are regarded as 3D images and the similarity between them is calculated by detecting keypoints from the images and computing local features at each keypoint. We applied the proposed method to prediction of protein's binding sites, which shows the accurate prediction of binding sites in six out of eleven proteins.