1 0 0 0 OA E.coli K12におけるterminator配列の探索
- 著者
- 横瀬 拓也 山内 直揮 高橋 紘一
- 出版者
- 公益社団法人 日本化学会・情報化学部会
- 雑誌
- ケモインフォマティクス討論会予稿集 第31回情報化学討論会 東京
- 巻号頁・発行日
- pp.P9, 2008 (Released:2008-11-06)
- 参考文献数
- 5
オペロンの下流に存在するターミネータ領域の探索を行った。RNAの構造解析に使用されるドットマトリックス法において、自由エネルギーを評価値として用いることで、ターミネータ領域探索法を構築した。E.coli K12の各遺伝子領域の下流60塩基配列のターミネータ解析を行ったところ、スコアの高いものと低いものがみつかった。前者はρ-非依存性、後者はρ-依存性ターミネータに相当するものと思われる。
1 0 0 0 OA ヘテロツリー表現に基づく分子の三次元構造類似性探索
- 著者
- 田中 裕貴 加藤 博明
- 出版者
- 公益社団法人 日本化学会・情報化学部会
- 雑誌
- ケモインフォマティクス討論会予稿集 第31回情報化学討論会 東京
- 巻号頁・発行日
- pp.P14, 2008 (Released:2008-11-06)
- 参考文献数
- 3
化学物質の種々の性質はその化学構造と密接に関連していることがよく知られている。本研究では、分子におけるヘテロ原子の局所的な空間配置に注目し、ヘテロ原子間の三次元距離情報をもとに生成した最小全域木(ヘテロツリー)を定義した。CSDから抽出した一群の化合物データに対してヘテロツリーの生成を行い、その出現頻度を求めるとともに、特徴的なヘテロツリーパターンと活性との相関についても調査を試みている。