著者
篠田 渉
出版者
一般社団法人 日本生物物理学会
雑誌
生物物理 (ISSN:05824052)
巻号頁・発行日
vol.60, no.3, pp.157-161, 2020 (Released:2020-05-27)
参考文献数
16
被引用文献数
1 1

We illustrate a series of molecular dynamics simulations of lipid membranes using the coarse-grained model, SPICA force field. The force field was designed to reproduce the experimental thermodynamic quantities such as surface tension, density, and solvation free energy, and simultaneously the molecular distribution functions calculated from all-atom molecular simulations. Further, the elastic properties and line tension of lipid membranes are well reproduced, which guarantees a reasonable morphology of lipid aggregates. The molecular library now includes several different lipids as well as cholesterols. Large scale simulations and free energy calculations are described to show the performance of the SPICA force field.

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@KentaroOnizuka 加えて、ミセル構造は計算出来ないとおっしゃっていましたが、近年様々な手法が開発されているようです。 岡山大学と名古屋大学がSPICAという粗視化分子動力学計算を開発しています。 https://t.co/ADOTjIkbIt

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