著者
Nobuaki Yasuo Keisuke Watanabe Hideto Hara Kentaro Rikimaru Masakazu Sekijima
出版者
Information Processing Society of Japan
雑誌
IPSJ Transactions on Bioinformatics (ISSN:18826679)
巻号頁・発行日
vol.11, pp.41-47, 2018 (Released:2018-12-10)
参考文献数
36
被引用文献数
5

Lead optimization is an essential step in drug discovery in which the chemical structures of compounds are modified to improve characteristics such as binding affinity, target selectivity, physicochemical properties, and toxicity. We present a concept for a computational compound optimization system that outputs optimized compounds from hit compounds by using previous lead optimization data from a pharmaceutical company. In this study, to predict the drug-likeness of compounds in the evaluation function of this system, we evaluated and compared the ability to correctly predict lead optimization strategies through learning to rank methods.

言及状況

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公開されてるから言えるのか。武田にいた力丸さんとの仕事がこれです→https://t.co/fQMg1sVqFw この当時は、製薬企業データが外に出ることがなく、この研究で用いたリード最適化のプロジェクトの化合物ハッシュとはいえ、外に出たのは大きいことでした。 https://t.co/FtmOY9u0cH
IPSJ Transactions on Bioinformaticsの昨年12月のアクセスランキング、これまでに引続き、私たちの論文がトップでした。お読み頂いた皆様、ありがとうございました
”Predicting Strategies for Lead Optimization via Learning to Rank”が、IPSJ Transactions on Bioinformaticsの2019年11月に最も読まれた論文でした。ありがとうございます。 https://t.co/SOaBckIIAc https://t.co/Ak5TBIQpUn
@maskot1977 @fmkz___ この程度しか出来ないことを既に知っているはず。。。 https://t.co/fQMg1sVqFw
ちなみに、machine learning lead optimization をググると最初に出るのは、多分僕たちの論文です。 https://t.co/1vBUJfG5NV 武田の実際のリード最適化のプロジェクトのフィンガープリントを相手にやった研究です。今見ると、kaggleのコンテストみたいですね。 https://t.co/loz5IWakez
IPSJ Transactions on Bioinformaticsに12月に出版した私たちの論文へのアクセスが、先月(3月)もアクセストップでした。実は、東工大と武田薬品との共同研究はここまで遡ります。ちなみに、、論文はこちら→ https://t.co/fQMg1sVqFw https://t.co/k9da3xBbS2
私たちが12月に出した論文がTBIOでMost viewed articles Jan.2019になっていました。小さな一歩ですが嬉しいです。 /J-STAGE Articles - Predicting Strategies for Lead Optimization via Learning to Rank https://t.co/oq9i2p2wxY https://t.co/kOce2IeSQe
Lead optimizationの化合物のランキングを学習する #cbiwakate https://t.co/JWBbzRvCX9
J-STAGE Articles - Predicting Strategies for Lead Optimization via Learning to Rank https://t.co/WUjADpF5tV
武田薬品工業株式会社との共同研究で、過去のリード最適化のプロジェクトのデータを学習することで別のプロジェクトの最適化を予測できるか、という論文を書きました。この時は、ECFPを用いました。 / Predicting Strategies for Lead Optimization via Learning to Rank https://t.co/oq9i2p2wxY

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