10 0 0 0 OA 海外だより ~構造解析ソフトウェア開発の本場から~
- 著者
- 山下 恵太郎
- 出版者
- 一般社団法人 日本生物物理学会
- 雑誌
- 生物物理 (ISSN:05824052)
- 巻号頁・発行日
- vol.63, no.5, pp.289-290, 2023 (Released:2023-11-25)
- 参考文献数
- 1
9 0 0 0 OA Servalcatによるクライオ電子顕微鏡単粒子解析の構造精密化とマップ計算
- 著者
- 山下 恵太郎
- 出版者
- 日本結晶学会
- 雑誌
- 日本結晶学会誌 (ISSN:03694585)
- 巻号頁・発行日
- vol.64, no.2, pp.118-124, 2022-05-31 (Released:2022-06-01)
- 参考文献数
- 15
Atomic model refinement and map calculation methods for cryo-EM single particle analysis(SPA)are explained in relation to X-ray crystallography. To make the best use of high-resolution reconstructions from SPA, it is important to calculate interpretable density maps to help build atomic models, and to use all experimental information to refine models. We developed a new program Servalcat to facilitate the structure refinement in reciprocal space. Servalcat performs structure refinement using REFMAC5, followed by calculation of weighted and sharpened Fo and Fo-Fc maps, which are useful in manual model rebuilding.