- 著者
- 長嶋 雲兵 渡辺 寿雄 稲富 雄一 石元 孝佳 梅田 宏明 櫻井 鉄也
- 出版者
- 公益社団法人 日本化学会・情報化学部会
- 雑誌
- 日本化学会情報化学部会誌 (ISSN:09133747)
- 巻号頁・発行日
- vol.25, no.2, pp.40, 2007 (Released:2007-06-27)
- 参考文献数
- 18
2 0 0 0 OA OpenFMOにおける4中心クーロン相互作用項計算のGPGPU化の試み
- 著者
- 梅田 宏明 塙 敏博 庄司 光男 朴 泰祐 重田 育照
- 出版者
- 日本コンピュータ化学会
- 雑誌
- Journal of Computer Chemistry, Japan (ISSN:13471767)
- 巻号頁・発行日
- vol.14, no.3, pp.69-70, 2015 (Released:2015-09-25)
- 参考文献数
- 6
- 被引用文献数
- 5
GPU acceleration of four-center (4C) inter-fragment Coulomb interaction term (IFC) for OpenFMO, a fragment molecular orbital calculation program, has been implemented and its performance was examined. FMO calculation has two time-consuming steps: Fock matrix construction and IFC calculation, and in our previous letter, it was reported that the former is successfully accelerated with our GPU-enable code. The 4C-IFC calculation is the core part of the latter and its code is similar to that of Fock matrix construction. In this letter, we briefly describe the GPU-accelerated 4C-IFC calculation routine, and report a performance benchmark for GPU-accelerated FMO calculation. The GPU-accelerated program shows 3.3× speedups from CPU only FMO-HF/6-31G (d) calculation for 642 atomic protein on 8 nodes of HA-PACS base cluster.
1 0 0 0 OA GAMESSによる大規模並列FMO計算に向けた取り組み
- 著者
- 梅田 宏明
- 出版者
- 公益社団法人 日本化学会・情報化学部会
- 雑誌
- 日本化学会情報化学部会誌 (ISSN:09133747)
- 巻号頁・発行日
- vol.32, no.1, pp.2, 2014 (Released:2014-01-24)
- 参考文献数
- 10