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文献一覧: 藤田 典昭 (著者)
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JCGGDB および国際糖鎖構造リポジトリの開発
著者
木下 聖子
鹿内 俊秀
奥田 修二郎
川㟢 敏祐
成松 久
新町 大輔
藤田 晶大
土屋 伸一郎
藤田 典昭
鈴木 芳典
ソロビヨワ イェレナ
松原 正陽
山田 一作
出版者
日本プロテオーム学会(日本ヒトプロテオーム機構)
雑誌
日本プロテオーム学会大会要旨集
巻号頁・発行日
vol.2014, pp.27, 2014
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国際標準化糖鎖構造表記法WURCSの開発
著者
山田 一作
ソロビヨワ イェレナ
藤田 典昭
奥田 修二郎
川嵜 敏祐
成松 久
木下 聖子
松原 正陽
土屋 伸一郎
新町 大輔
藤田 晶大
青木 信幸
鹿内 俊秀
鈴木 芳典
出版者
公益社団法人 日本化学会・情報化学部会
雑誌
ケモインフォマティクス討論会予稿集
巻号頁・発行日
vol.2014, pp.O10, 2014
糖鎖研究において産出された糖鎖データには様々な表現方法が存在しており、このことは近年のウェブ技術を利用したライフサイエンスデータベース間の連携の妨げとなっていた。そこで我々は、糖鎖構造に対する新たな表記法としてWURCS(Web3 Unique Representation of Carbohydrate Structures)を開発した。WURCSは、曖昧さを含むあらゆる糖鎖構造を一意に表せる線形表記法であり、URIとして利用可能である。併せて、糖鎖データベースの構造データからWURCSに変換するソフトウェアを開発した。これにより共通の糖鎖構造を含む分子の横断検索が可能となる。また、WURCS普及促進のためのWURCSWorkingGroupを組織し、国際標準化に向けた活動を行っている。