著者
Hideki Kakeya Yoshihisa Matsumoto
出版者
Information Processing Society of Japan
雑誌
IPSJ Transactions on Bioinformatics (ISSN:18826679)
巻号頁・発行日
vol.15, pp.22-29, 2022 (Released:2022-11-16)
参考文献数
35

A method to find a probability that a given bias of mutations occur naturally is proposed to test whether a newly detected virus is a product of natural evolution or a product of non-natural process such as genetic manipulation. The probability is calculated based on the neutral theory of molecular evolution and binominal distribution of non-synonymous (N) and synonymous (S) mutations. Though most of the conventional analyses, including dN/dS analysis, assume that any kinds of point mutations from a nucleotide to another nucleotide occurs with the same probability, the proposed model takes into account the bias in mutations, where the equilibrium of mutations is considered to estimate the probability of each mutation. The proposed method is applied to evaluate whether the Omicron variant strain of SARS-CoV-2, whose spike protein includes 29 N mutations and only one S mutation, can emerge through natural evolution. The result of binomial test based on the proposed model shows that the bias of N/S mutations in the Omicron spike can occur with a probability of 2.0 × 10-3 or less. Even with the conventional model where the probabilities of any kinds of mutations are all equal, the strong N/S mutation bias in the Omicron spike can occur with a probability of 3.7 × 10-3, which means that the Omicron variant is highly likely a product of non-natural process including artifact.

言及状況

外部データベース (DOI)

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Scopusによると貴殿は3年間論文を1本も書いていませんが(そもそも筆頭著者論文は人生で1本だけ)、私は新型コロナ起源に関して査読付き雑誌論文を既に1本書いています。プレプリントも1本。いずれも筆頭著者です。 https://t.co/7ZsHmBfv9u https://t.co/ul3iGvYdiA https://t.co/DTBzRsOSUK
@7_vatan Japanese scientists have used mathematical probability 2 suggest "the strong N/S mutation bias in the #Omicron spike can occur with a probability of 3.7 × 10-3, which means that the Omicron variant is highly likely a product of non-natural process" https://t.co/DUsSyhC87y
私は既に査読付き学術誌に論文を発表してしまったのですが、私は殺されるのでしょうか? https://t.co/7ZsHmBfv9u https://t.co/ynvJbrpQyl
宮沢先生が私と松本教授(東工大)の論文と来週の分子生物学会での発表に言及してくれています。論文はこちら。 https://t.co/7ZsHmBfv9u 分子生物学会の発表は3P-325, 12/2 13:45~14:45です。発表予定の内容はプレプリントで公表しています。 https://t.co/ul3iGvYdiA https://t.co/HI0JJrXPEA
@inferist @TM_Quencher 日本の情報処理学会 バイオ情報学研究会に出されたようですよ https://t.co/5x1b6jEa3H
@takavet1 このような論文もありますが、オミクロンはSARS-CoV-2なんですか? ウイルスはどのようなルールで(どの程度の相同性で)同種と判断されるんですか? https://t.co/izrV1bsCyC
@okowanisuterare @vague_flavor5 @AMEchanYoosei @hkakeya ボク何歳なの? 140文字以内でこの論文のサマリーを書いて見ろよw A Probabilistic Approach to Evaluate the Likelihood of Artificial Genetic Modification and Its Application to SARS-CoV-2 Omicron Variant https://t.co/DjF3d7RJMC
@vague_flavor5 @okowanisuterare @AMEchanYoosei @hkakeya まだ構って欲しいなら この論文を科学的に批評してからね おまえのくだらん憂さ晴らしに 付き合い暇はないよw A Probabilistic Approach to Evaluate the Likelihood of Artificial Genetic Modification and Its Application to SARS-CoV-2 Omicron Variant https://t.co/DjF3d7RJMC
@hatehatenanaha @ujPoY5saaK4bJVY 原論文には、 SARS-CoV-2のオリジナルあるいはオミクロン変異型が、世界のいずれかの研究室における遺伝子組み換えの産物であると結論づける決定的な証拠はないのは事実 と明記してあるわけだが―― https://t.co/fqyM28xbIW
オミクロンの変異体は、人工的な遺伝子改変を含む非自然的なプロセスの産物である可能性が高いという論文 https://t.co/BcaV1lApTw ファウチ・ダスザックのコンビが機能獲得研究を武漢ウイルス研究所に委託していた「ウイルス流出説」の可能性も当然より強く疑われる https://t.co/ioU7bzXEiM
A Probabilistic Approach to Evaluate the Likelihood of Artificial Genetic Modification and Its Application to SARS-CoV-2 Omicron Variant https://t.co/iwkMhwoAp1
@katayama_s それよりも先にあなた方がやることは、新型コロナの感染者数世界最多が日本であること、日本で甚大な数の超過死亡が発生していることを究明することですよ。コロナが生物兵器だったらどうするんですか。しかも、モンゴロイドを標的にした生物兵器だったら。https://t.co/Txk5QF5DLu
J-STAGE Articles - A Probabilistic Approach to Evaluate the Likelihood of Artificial Genetic Modification and Its Application to SARS-CoV-2 Omicron Variant https://t.co/TF6lIBx101
A Probabilistic Approach to Evaluate the Likelihood of Artificial Genetic Modification and Its Application to SARS-CoV-2 Omicron Variant https://t.co/YU83ipGPPb
オミクロン株が遺伝子の【人工的改変を含む非天然由来の可能性】が高いことを示す査読済み論文が!! https://t.co/zAlvuvCgzb
オミクロン株も人工である可能性が高い。かなり高い。 J-STAGE Articles - A Probabilistic Approach to Evaluate the Likelihood of Artificial Genetic Modification and Its Application to SARS-CoV-2 Omicron Variant https://t.co/RyLdAMHehF
オミクロン株は人口の可能性かなり高い J-STAGE Articles - A Probabilistic Approach to Evaluate the Likelihood of Artificial Genetic Modification and Its Application to SARS-CoV-2 Omicron Variant https://t.co/RyLdAMHehF
#Omicron not natural. Heared that before. @tony_vandongen https://t.co/Bjhk5mKmce
"the Omicron variant is highly likely a product of non-natural process including artifact" https://t.co/29fCojmspa
オミクロン株が遺伝子の人工的改変を含む非天然由来の可能性が高いことを示す査読済み論文がIPSJ Transactions on Bioinformatics(情報処理学会の英文誌)に掲載されました。 https://t.co/7ZsHmBfv9u
Our paper below, which shows that the Omicron variant is highly likely a product of non-natural process including artificial genetic modification, is published in IPSJ Trans. on Bioinformatics. https://t.co/7ZsHmBfv9u

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