5 0 0 0 300年経過の資料を用いた伊達家三藩主のDNA解析
3 0 0 0 化石DNA及び現存種の遺伝子情報にもとづく生物の分子進化学的研究
本研究の目的は,保存状態が極めて良い化石資料からDNAの抽出を試み,抽出されたDNAを基質としてPCRによって特定の遺伝子領域を増幅した後,塩基配列の決定を行い,近縁の現存種の遺伝子情報と比較し,生物の系統進化を明らかにすることにある.研究計画に示された内容について研究期間中に以下の成果を得た.1.化石骨などの化石資料からのDNAの抽出法,化石化の過程で低分子化したDNAを基質としてかつ生体高分子の続成過程で生じた多くの阻害物質を克服してPCR反応を効率的に進行させる方法といった実験手法の問題につき基礎研究を行い手法を確立した.2.ロシア科学アカデミーに所蔵されているシベリアの永久凍土産の5万3000年より10000年前のマンモス化石および現存種のアフリカゾウ・アジアゾウよりミトコンドリアDNAを抽出し,チトクロームb遺伝子領域307塩基対をはじめとした二三の遺伝子の領域の配列決定を行い,ゾウ亜科の分子系統樹を構築した.その結果,これまでの形態に基づく系統関係の通説と異なりマンモスはアフリカゾウにより近縁であることが明らかになった.また,分子時計によれば両者の分岐年代は約700万年前と推定される.なお,今回の4万3000年前のマンモス化石からのDNAの塩基配列決定は,コハク中の昆中化石を除き,現在のところ動物化石では最も古いDNAの抽出および塩基配列決定例である.3.化石記録の豊富な海生腹足類キサゴ類を対象に,現生種のミトコンドリアDNAのいくつかの遺伝子領域の塩基配列データに基づき分子系統樹を作成し,化石記録と形態に基づく系統樹と比較検討した計果,形態にもとづく系統樹は生態型を反映したものであり真の系統関係を反映していないことが判明した.また,キサゴ類の種分化は海洋気候の温暖期より寒冷期に集中して生じていることが判明した.
- 著者
- 小澤 智生
- 出版者
- 雄山閣出版
- 雑誌
- 季刊考古学 (ISSN:02885956)
- 巻号頁・発行日
- no.73, pp.17-22, 2000-11
縄文・弥生時代の考古学的遺跡から産するいわゆる古代豚とされる獣骨が,野生のニホンイノシシなのか家畜豚であるかを遺伝学的に特定するための基礎データを得るため,ユーラシア大陸及び東アジア・東南アジアの島嶼域に棲息するイノシシ属(Sus)の野生種及び家畜豚のミトコンドリアDNAシトクロームbの全塩基配列およびミトコンドリアDNAのD-loop領域の一部の配列決定を行い,野生イノシシおよび家畜豚の遺伝学的特性を明らかにした.これらの基礎研究をふまえ,考古学的遺跡産の試料として,縄文時代晩期の佐賀県菜畑遺跡産(4試料),弥生時代の大分県下郡遺跡産(3試料),愛知県朝日貝塚産(3試料)の典型的な古代豚とされる骨を選び抽出された古代DNAをPCRで増幅しミトコンドリアDNA調節遺伝子領域255塩基対の配列を決定し,アジア・日本のイノシシ及び豚の配列と比較を行った.その結果,10試料中の9試料の配列はニホンイノシシ集団に固有に認められる配列であり,残りの1試料の配列はニホンイノシシ集団と東南アジアの一部の豚に認められる配列であることを確認した.この事実は縄文時代晩期から弥生時代の日本の稲作文化において,大陸産の家畜豚が飼われていなかったことを示唆している.本研究では,さらに縄文時代の遺跡産試料,琉球列島の貝塚時代の試料についても,予察的ながら形態ならびに分子考古学的検討を行ったがすべてが野生イノシシであり家畜豚である事実は得られなかった.一方,遺跡出土骨の形態学的研究の基礎試料を得るため,日本各地のニホンイノシシ集団の頭骨の形態計測学的研究を行い,野生集団の形態学的特性を主として主因子分析の立場から明らかにした.次に,縄文・弥生遺跡出土ノイノシシならびに古代豚とされる頭蓋の比較形態学的計測を行い,現生ニホンイノシシのデータと比較した.その結果,遺跡出土の試料は,いずれもニホンイノシシの形態変異の範疇に入り,ニホンイノシシと区別する事が出来なかった.これらの一連の事実から,考古学者の一部が主張するいわゆる古代豚というものの存在は否定される結果となった.
1 0 0 0 OA 花粉分析からみた琉球列島の植生変遷と古気候
- 著者
- 黒田 登美雄 小澤 智生
- 出版者
- 公益社団法人 東京地学協会
- 雑誌
- 地学雑誌 (ISSN:0022135X)
- 巻号頁・発行日
- vol.105, no.3, pp.328-342, 1996-06-25 (Released:2009-11-12)
- 参考文献数
- 29
- 被引用文献数
- 9 15
Paleoclimatic and vegetational changes during the Pleistocene and Holocene in the Ryukyu Islands were inferred from pollen assemblages. Pollen analyses of some early Pleistocene to Holocene sections in the Ryukyu Islands show several drastic vegetational changes with climatically meaningful variations.A mixed pollen assemblage containing the warm and cool temperate trees such as Cryptomeria, Abies and Tsuga, and the tropical-subtropical trees including Dacrydium, Liquidambar, , Lagerstroemia and Sapium occurred in the upper Pliocene to lower Pleistocene Shinzato Formation and the basal part of the lower Pleistocene Kunigami gravel formation. These pollen assemblages strongly support that there were high mountains over 1, 000 to 1, 500 m above the sea-level in the Ryukyu Islands in the late Pliocene to early Pleistocene. The warm and cool temperate forests in the mountainous areas were disappeared possibly by the subsidence of the basement rocks of the Islands in relation with the opening of the Okinawa Trough. Invasion of evergreen broad-leaved trees to the Ryukyu Islands in the early Pleistocene was indicated by the first occurrence of evergreen broad-leaved tree pollen in the lower Pleistocene Kunigami Gravel Formation.The pollen assemblages in the last Glacial period (ca. 22, 000 y.B.P) are dominated by the coniferous trees such as Pinus and Podocarpus, indicating that an arid climate was prevalent in the Ryukyu Islands. This evidence is consistent with the wide development of ancient dunes and paleosoil of aeolian sand origin in the islands during the last Glacial period. The pollen sequence of the uppermost Pleistocene to Holocene reveals the change of vegetation and climate from the pine forests of the late Glacial period to the climax forests of evergreen broad-leaved trees of the Climatic Optimum. It is suggested that the climatic condition in subtropical Ryukyu Islands around 20, 000 years B.P. was not so much cool but arid than the climate of the present day.
1 0 0 0 OA シャミセンガイの遺伝的変異(生きている化石)
The inarticulate brachiopod Lingula has been regarded as a typical "living fossil" because of its extreme morphologic conservation signified by its longest geological history among known living animal genera. To make clear the mechanisms of the evolutionary conservatism, an investigation of genetic structures of two Japanese populations of Lingula anatina (Ariake Bay population in Kyushu, southern Japan and Mutsu Bay population in northeastern Japan) has been conducted, along with morphometric investigations of the shells. An electrophoretic survey of enzyme variations demonstrated that both populations of Lingula anatina retained a high level of genetic variability comparable with that of other marine animals. In contrast, the genetic distance between the two populations from localities up to 1500km apart is within the value that characterize conspecific populations. The genetic distances between the Japanese populations and the Queensland populations in Australia studied by Hammond and Poiner (1983) are also within the values usually recorded among the populations of a species. The strategy employed by Lingula to prolong pelagic larval existence may play an important role in maintaining a homogeneous population over this long geographic range. The panmixia among the populations of Lingula anatina sustained by the special dispersal mechanism may be one of the genetic mechanisms that keeps the species stable for a long time.