著者

井尻 成保 足立 伸次

出版者

公益社団法人 日本水産学会

雑誌

日本水産学会誌 (ISSN:00215392)

巻号頁・発行日

vol.86, no.2, pp.103, 2020-03-15 (Released:2020-03-31)

参考文献数

2

著者

井尻 成保 足立 伸次

出版者

公益社団法人 日本水産学会

雑誌

日本水産学会誌 (ISSN:00215392)

巻号頁・発行日

vol.85, no.2, pp.191, 2019-03-15 (Released:2019-04-02)

参考文献数

3

著者

泉 ひかり 萩原 聖士 玄 浩一郎 井尻 成保 足立 伸次

出版者

北海道大学大学院水産科学研究院

雑誌

北海道大学水産科学研究彙報 (ISSN:13461842)

巻号頁・発行日

vol.65, no.3, pp.125-130, 2015-12-20

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Removal of ribosomal RNAs(rRNA) from total RNA in eggs before preparation of a RNA library is required for the analysis of maternal mRNA using next-generarion sequencing ; this mRNA is essential for normal development. In mammals, the rRNA-depletion method is well-established and is already being used for the development of experiment kits. However, this method is not designed for other species, e.g., non-model organisms. In the current study, we attempted to remove rRNA from total RNA of Japanese eel Anguilla japonica, which is one of the most important aquaculture species in Japan. Removal was performed via hibridization-selection using mammalian probes from a commmercially available kit and/or an ordinally designed eel probe. Quantitative polymerase chain reaction(PCR) was performed to examine the depletion efficiency of 18S rRNA and 28S rRNA were comparative between each method, and >98% depletion was achieved. In addition, RNA-sequencing analysis using a next-generation sequencer and read-mapping analysis were carried out using the rRNA-depleted RNA, which was prepared using a mammalian probe, and mapping analysis revealed that rRNA reads were <1% of the total reads. These results suggest that an rRNA-depletion kit designed for a mammal can also be used for fish species.

著者

塚本 勝巳 大竹 二雄 金子 豊二 井尻 成保 青山 潤

出版者

日本大学

雑誌

基盤研究(S)

巻号頁・発行日

2009-05-11

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天然の生理生態情報を基に親魚の催熟・採卵技術と仔魚の飼育法を改善した。卵巣遺伝子の網羅的解析の結果、天然魚ではアンドロゲン受容体タイプA(ara)とアクアポリン-0および-3パラログ遺伝子が大量に発現していることを見出し、良質卵産生のための重要な指標を得た。仔魚の浸透圧調節能と栄養吸収機構の発達を調べたところ、イオン輸送体のNKCC2bとNCCbはふ化後2-3日目に消化管に発現し、水飲みの亢進と同期すること、ペプチド輸送体PEPT1は腸管上皮細胞の頂端部に局在することが分かり、飼育プロトコルが改善された。天然仔魚の体成分アミノ酸窒素同位対比分析から餌はマリンスノーと判明し、新規飼料を開発した。

著者

足立 伸次 井尻 成保

出版者

北海道大学

雑誌

基盤研究(B)

巻号頁・発行日

2017-04-01

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チョウザメの性分化および卵成熟/排卵に関わる因子を、次世代シーケンサー(NGS)を用いて網羅的に解析することで、それらの機能、特異性および動態などの膨大な情報を短期間で集積し、チョウザメの生殖現象の分子機構解明を推進した。また、各ステージに特徴的な多数の分子マーカーを探索し、それらを利用して、早期性判別、安定的良質卵生産技術およびすべての結果を結集した全雌生産技術開発を進めた。その結果、ついにホルモンを用いないチョウザメの全雌生産の実現が目前に迫った。