著者
檜作 洋平
出版者
一般社団法人 日本生物物理学会
雑誌
生物物理 (ISSN:05824052)
巻号頁・発行日
vol.59, no.2, pp.079-083, 2019 (Released:2019-03-26)
参考文献数
20

Intramembrane-cleaving proteases (I-CLiPs) are a unique class of proteases, which catalyze proteolysis of target membrane proteins within the lipid bilayer. I-CLiPs are found in all kingdoms of life and are involved in various cellular processes such as stress responses, lipid homeostasis, induction of apoptosis and bacterial virulence. RseP, an Escherichia coli I-CLiP, plays a critical role in the extracytoplasmic stress response essential for bacterial survival. In this review, I will summarize the results of our recent studies on the structure and function of RseP and propose a model of the substrate recognition and cleavage by this peculiar protease.
著者
後藤 俊夫
出版者
一般社団法人 日本生物物理学会
雑誌
生物物理 (ISSN:05824052)
巻号頁・発行日
vol.12, no.2, pp.69-78, 1972-03-25 (Released:2009-05-25)
参考文献数
50
被引用文献数
1 1
著者
角田 聡
出版者
一般社団法人 日本生物物理学会
雑誌
生物物理 (ISSN:05824052)
巻号頁・発行日
vol.57, no.4, pp.179-185, 2017 (Released:2017-07-28)
参考文献数
28

The microbial rhodopsins are a class of membrane proteins with seven transmembrane helices harboring an all-trans retinal retinal chromophore. The functions of microbial rhodopsins are diverse, including light-driven cation and anion pumps, light-gated cation and anion channels, positive and negative phototaxis sensors, photochromic sensors, and light-activated enzymes. Here I focus on the ion-transporting rhodopsins and explain the mechanism of the pumps and the channels revealed by the electrophysiological studies. Characteristics of light-gated cation channel (channelrhodopsins) and proton-pumping rhodopsins are discussed.
著者
鹿島 騰真 石渡 明弘 藤田 清貴 伏信 進矢
出版者
一般社団法人 日本生物物理学会
雑誌
生物物理 (ISSN:05824052)
巻号頁・発行日
vol.62, no.3, pp.184-186, 2022 (Released:2022-07-25)
参考文献数
6

ヒトは火を使って調理することでカラメルのように天然には存在しない糖質を含んだ食品を生み出している.私達はビフィズス菌でカラメル化糖に含まれるinulobioseの脱水縮合を平衡的に触媒し,difructose dianhydride I(DFA I)を生成するDFA I synthase/hydrolase(αFFase1)を発見した.本稿ではαFFase1の機能を特定した経緯とX線結晶構造解析による構造基盤について述べる.
著者
佐藤 竜馬 森 義治 松井 理紗 沖本 憲明 山元 淳平 泰地 真弘人
出版者
一般社団法人 日本生物物理学会
雑誌
生物物理 (ISSN:05824052)
巻号頁・発行日
vol.62, no.2, pp.116-118, 2022 (Released:2022-05-25)
参考文献数
10

DASH型クリプトクロムは発見当初,紫外線損傷DNAを光回復できると推定された.しかし,現実にはその機能を発現せず,その明確な理由は明らかではない.本稿では,紫外線損傷DNAの光回復に欠くことのできない電子移動反応および基質の認識・結合の観点から機能の非発現の理由について調べた研究について紹介する.
著者
渡邉 宙志
出版者
一般社団法人 日本生物物理学会
雑誌
生物物理 (ISSN:05824052)
巻号頁・発行日
vol.62, no.2, pp.119-121, 2022 (Released:2022-05-25)
参考文献数
10

水素イオンは生体分子の理解に重要だが,分子シミュレーションにおいて最も取り扱いが難しい対象で,従来小さな系でのダイナミクスしか再現できなかった.今回,ハイブリッド分子モデルQM/MM法を拡張することでバルクでのプロトン輸送を再現した.これによりタンパク質など巨大系のプロトン輸送も取り扱い可能になる.
著者
高畑 尚之
出版者
一般社団法人 日本生物物理学会
雑誌
生物物理 (ISSN:05824052)
巻号頁・発行日
vol.23, no.4, pp.167-171, 1983-07-25 (Released:2009-05-25)
参考文献数
21
著者
原 雄二 土谷 正樹 平野 航太郎 梅田 眞郷
出版者
一般社団法人 日本生物物理学会
雑誌
生物物理 (ISSN:05824052)
巻号頁・発行日
vol.60, no.4, pp.222-226, 2020 (Released:2020-07-29)
参考文献数
20

Fusion of myoblast cells and subsequent formation of multinucleated cells (called myotubes) are fundamental steps for generation of myofibers. In this review we focus on a role of phospholipid flippase complex ATP11A/CDC50A, a phospholipid translocase that transports phospholipids from the outer to the inner leaflets, during myotube formation. We show that translocation of phosphoatidylserine (PS) via phospholipid flippase is essential for positive regulation of PIEZO1, a mechanosensitive ion channel that is activated by membrane tension, thereby promoting RhoA/ROCK-mediated actomyosin formation that is critical for determination of myotube morphology.
著者
佐々木 顕
出版者
一般社団法人 日本生物物理学会
雑誌
生物物理 (ISSN:05824052)
巻号頁・発行日
vol.27, no.6, pp.287-291, 1987-11-25 (Released:2009-05-25)
参考文献数
15

The evolution of natal emigration is studied theoretically assuming exogamy. The model predicts that extremely sex-biased pattem of natal emigration should be evolved, and that less productive sex is to leave the natal troop. Observed patterns of natal dispersal in bird alld nammal species are discussed, in relation to the present model.
著者
平井 照久
出版者
一般社団法人 日本生物物理学会
雑誌
生物物理 (ISSN:05824052)
巻号頁・発行日
vol.47, no.5, pp.317-322, 2007 (Released:2007-09-28)
参考文献数
21
被引用文献数
1 1

Major facilitator superfamily (MFS) is the largest family of secondary transporters. MFS includes uniporter, antiporter and symporter. The structure of oxalate transporter reported by electron crystallography showed a “closed” conformation and it revealed remarkably symmetric architecture with twelve helices surrounding a central cavity. Some of the structures reported by X-ray crystallography showed “open” conformation. Comparing these structures, a transport mechanism based on the simple domain movement has been proposed.
著者
藤田 祐一 栗栖 源嗣
出版者
一般社団法人 日本生物物理学会
雑誌
生物物理 (ISSN:05824052)
巻号頁・発行日
vol.51, no.2, pp.066-071, 2011 (Released:2011-03-30)
参考文献数
25
被引用文献数
1

Protochlorophyllide (Pchlide) reduction is the final step to make up the spectroscopic properties of chlorophyll a in biosynthesis of chlorophyll. During evolution, photosynthetic organisms have invented two structurally unrelated Pchlide reductases; light-dependent Pchlide reductase (LPOR) and light-independent (dark-operative) Pchlide reductase (DPOR). LPOR is an NADPH-dependent enzyme operating as a key enzyme for the light-dependent greening in angiosperms, and DPOR is a nitrogenase-like enzyme that allows gymnosperms, algae, cyanobacteria and photosynthetic bacteria to produce (bacterio)chlorophylls even in the dark. We will review recent major research progresses on Pchlide reductases, especially, crystallographic structure and proposed reaction mechanism of DPOR. Differential operation and evolutionary implications of these enzymes are also discussed.
著者
市村 昭二
出版者
一般社団法人 日本生物物理学会
雑誌
生物物理 (ISSN:05824052)
巻号頁・発行日
vol.6, no.3, pp.115-130, 1966-05-25 (Released:2009-05-25)
参考文献数
69
被引用文献数
1 1