著者

難波 啓一

出版者

日本ウイルス学会

雑誌

ウイルス (ISSN:00426857)

巻号頁・発行日

vol.51, no.1, pp.63-71, 2001-06-01 (Released:2010-03-12)

参考文献数

28

著者

南野 徹 木下 実紀 森本 雄祐 難波 啓一

出版者

一般社団法人 日本生物物理学会

雑誌

生物物理 (ISSN:05824052)

巻号頁・発行日

vol.62, no.3, pp.165-169, 2022 (Released:2022-07-25)

参考文献数

19

被引用文献数

1

---

細菌の運動器官であるべん毛を作るために必要なタンパク質輸送装置は,細胞膜を隔てた電位差を主要な動力源に利用してべん毛の部品を細胞外へ運び出す.この輸送装置には,プロトン駆動型輸送エンジンに加え,ナトリウム駆動型エンジンや膜電位センサーが搭載されていることが,最近の筆者らの研究で明らかとなった.

著者

森本 雄祐 上池 伸徳 難波 啓一 南野 徹

出版者

一般社団法人 日本生物物理学会

雑誌

生物物理 (ISSN:05824052)

巻号頁・発行日

vol.57, no.6, pp.296-298, 2017 (Released:2017-11-30)

参考文献数

6

著者

難波 啓一

出版者

一般社団法人 日本生物物理学会

雑誌

生物物理 (ISSN:05824052)

巻号頁・発行日

vol.60, no.6, pp.357-358, 2020 (Released:2020-11-28)

参考文献数

4

著者

曽我部 正博 相沢 慎一 南野 徹 守屋 奈緒 難波 啓一

出版者

The Biophysical Society of Japan General Incorporated Association

雑誌

生物物理 (ISSN:05824052)

巻号頁・発行日

vol.48, no.2, pp.134-136, 2008

著者

難波 啓一

出版者

日本結晶学会

雑誌

日本結晶学会誌 (ISSN:03694585)

巻号頁・発行日

vol.30, no.6, pp.330-335, 1988-11-30 (Released:2010-09-30)

参考文献数

19

---

X-ray fiber diffraction method was used to deduce the molecular structure of tobacco mosaic virus. Multi- dimensional multiple isomorphous replacement method was applied to overcome the information loss by the cylindrical average in the fiber diffraction pattern, and some other developments in the analysis made it possible to build the molecular model of the whole virus particle. Protein- protein interaction and protein- RNA interaction found in the molecular structure gave us a clear understanding on the mechanism of self assembly.

著者

難波 啓一

出版者

一般社団法人日本生物物理学会

雑誌

生物物理 (ISSN:05824052)

巻号頁・発行日

vol.43, no.3, pp.118-123, 2003-05-25

---

The bacterial flagellar filament is a helical propeller for the rapid swimming of bacteria. Its gently curved and iwisted tubular structure is made of a single protein, flagellin, by its self-assembly in a helical manner. The mechanism for the formaiion of the left-handed helical tube for swimming and its dynamic polymorphic transition into right-handed forms for tumbling in response to quick reversal of the motor rotation has been revealed in the filament and protofilament structures at atomic detail obtained by convergent application of electron cryomicroscopy, X-ray fiber diffraction and X-ray crystallography with new technological devices in each of these methods.

著者

難波 啓一 今田 勝巳

出版者

大阪大学

雑誌

特定領域研究

巻号頁・発行日

2004

---

生命機能を支える生体超分子の動作のしくみを解明し、医療やナノテクノロジーに役立てるためには、原子分解能での立体構造解析法の確立が必須である。電子顕微鏡像の解析による超分子立体像解析では原子分解能達成は困難であるが、構成分子のX線結晶解析による原子モデルを超分子立体像に組み込むことにより、擬似原子分解能での解析が可能になる。本研究課題では電子顕微鏡像解析のさまざまな工夫によりその分解能の向上と解析時間の短縮を図り、原子モデルの組み込み精度を高めて、原子レベルでの動作機構の解明を実現した。

著者

難波 啓一 ROLAND DEGENKOLBE ROLAND DECENKOLBE

出版者

大阪大学

雑誌

特別研究員奨励費

巻号頁・発行日

2004

---

細菌の運動器官であるべん毛は、20種類の蛋白質から構成される生体超分子で、回転モータである基部体、らせん繊維型プロペラとして働くフィラメント、そしてそれらを連結してユニバーサルジョイントとして働くフックと、おおまかに3つの部分からなる。べん毛フィラメントはフラジェリンが非共有結合でらせん状に重合したチューブ構造で、極低温電子顕微鏡像の画像解析による構造解析法の長年にわたる工夫によってその原子モデルの構築に成功した(Yonekura et al., Nature 2003)。フックの構造については、その直線型構造の低温電子顕微鏡像解析による低分解能立体像と、サブユニット蛋白質FlgEのX線結晶構造解析法による原子モデルを組み合わせ、機能構造である曲がったフックの擬似原子モデルを構築し、それに基づく分子動力学シミュレーションにより、ドメイン間相互作用表面で一定数の水素結合やファンデアワールス接触点を保ちつつ結合相手を順次替えて相互滑りを起こし、各素繊維が約30%にもおよぶ伸縮をしてユニバーサルジョイント機能を実現することを明らかにした。(Samatey et al.Nature 2004)Roland DEGENKOLBE研究員は、べん毛基部体の蛋白質であるFliMとFliN、そしてべん毛蛋白質輸送装置の基幹サブユニットFliIとFliHが形成する複合体について、電子顕微鏡とX線回折法を組み合わせた超分子立体構造解析手法によるその全体構造の解析をめざしている。この複合体はべん毛の自己構築過程で、輸送の効率化を計るための非常に大切な役割を果たしており、構造が解けて原子モデルが構築できれば、べん毛蛋白質輸送のしくみについて大きな手がかりが得られると予想され、大変楽しみな研究プロジェクトである。そこで、DEGENKOLBE研究員は、この複合体の構成蛋白質を共発現する大腸菌大量発現系を用いた蛋白質試料の調整法、精製法の工夫を行い、結晶化とX線結晶構造解析、そして電子顕微鏡による立体構造解析をめざした研究作業を着実に進めてきた。いくつかの条件で微小な結晶が結晶化ドロップに現れ、それを拾い上げて実験室のX線回折装置にかけて回折能を確認したが、まだ良好な回折像は得られていない。結晶化条件をさらに工夫することにより結晶をより大きく成長させ、高分解能の回折反射を観測できるよう日夜がんばっている。この種類の仕事はリスクが大きく、本来ならば、2年間のJSPS特別研究員の短い期間中に挑戦するのには多大な困難が予想されるが、DEGENKOLBE研究員はこの難しい問題に果敢に挑戦し、質の高い成果を上げようとしており、その姿勢は高く評価できる。