著者

伊藤 翔 唐沢 康暉 星野 太佑 藤井 雅史 衛藤 樹 鶴 純也 柏戸 千絵子 黒田 真也

出版者

一般社団法人日本体力医学会

雑誌

体力科学 (ISSN:0039906X)

巻号頁・発行日

vol.68, no.3, pp.223-227, 2019-06-01 (Released:2019-05-18)

参考文献数

20

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We clarify the effect of combination of low-carbohydrate diet and resistance exercise training on physical characteristics and plasma concentrations of metabolites and hormones in humans. Intervention of low-carbohydrate diet and resistance exercise training were performed on 7 healthy men and 3 women (age 39.6 ± 7.0 year; BMI 25.1 ± 3.6 kg/m2) for 8 - 12 weeks. Physical characteristics and 106 test items including and blood concentrations of metabolites and hormones were measured before and after the intervention. The effects of intervention were analyzed by a paired t-test, in which multiple testing was corrected by the method of Storey (significant variation q <0.1). In both men and women, carbohydrate and energy intake per day were low, and protein intake per day was almost the same as the recommended dietary allowance. Because carbohydrate intake were limited (174 kcal), resulting in reduction of total energy (1186 kcal). After the intervention, body weight, BMI (Body Mass Index), fat mass, body fat, muscle mass and body water content significantly decreased, while muscle mass per body mass significantly increased. Glycine, 3-methyl histidine, inorganic phosphorous, urea nitrogen, urea nitrogen per creatinine, were significantly increased, while HbA1c, white blood cell count, β-aminoisobutyric acid, adrenalin, free T4, blood ammonia, γGTP, cholinesterase, and leptin were decreased.

著者

和田 卓巳 廣中 謙一 黒田 真也

出版者

一般社団法人 日本生物物理学会

雑誌

生物物理 (ISSN:05824052)

巻号頁・発行日

vol.61, no.5, pp.288-292, 2021 (Released:2021-09-28)

参考文献数

16

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Organisms can adapt to the environment robustly despite large heterogeneity of cellular response. Heterogeneity of cellular responses has been regarded as noise, which reduces accurate information transmission. The heterogeneity consists of intracellular variation caused by stochasticity of biochemical reactions, and intercellular variation caused by differences in amounts of molecules (cell-to-cell variability). We found that intercellular variation increases gradualness of the multi-cellular dose-response (response diversity effect), resulting in increase of accuracy of information transmission. This “response diversity effect” is a novel mechanism that enables multi-cellular organisms to utilize cell-to-cell variability as information not noise.

著者

幡野 敦 黒田 真也

出版者

日本プロテオーム学会

雑誌

日本プロテオーム学会誌 (ISSN:24322776)

巻号頁・発行日

vol.3, no.2, pp.37-45, 2018 (Released:2018-12-29)

参考文献数

28

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近年,細胞内で分子活性を計測するオミクス技術が次々と開発され,オミクス研究はこれまでの網羅的解析以上に多様な付加価値を持つようになった.一方でこれらのオミクスデータをどのように解析するかに関して明確な指針はなく,研究者それぞれが試行錯誤の末,データから新たな知見を見出すことが一般的である.そこで我々はオミクスデータ解析の一つの指針として多階層生化学反応ネットワークの再構築を行うトランスオミクス解析を提案している.トランスオミクス解析では複数のオミクスデータをデータベースに基づいた事前知識により統合することで多階層生化学反応ネットワークを再構築し,生化学反応の数理モデルにより反応網羅的にその特性を明らかとする.本稿ではトランスオミクスの概念を示し,実際にトランスオミクス解析に有用なプロテオミクス技術とそのメリット・デメリットについて紹介する.

著者

黒田 真也

雑誌

新学術領域研究(研究領域提案型)

巻号頁・発行日

2017-06-30

著者

木下 晴之 前川 敏郎 国田 勝行 黒田 真也 藤井 輝夫

出版者

一般社団法人 システム制御情報学会

雑誌

システム/制御/情報 (ISSN:09161600)

巻号頁・発行日

vol.61, no.7, pp.253-258, 2017-07-15 (Released:2018-01-15)

参考文献数

6

著者

久保田 浩行 黒田 真也

出版者

一般社団法人 日本生物物理学会

雑誌

生物物理 (ISSN:05824052)

巻号頁・発行日

vol.53, no.4, pp.184-189, 2013 (Released:2013-07-25)

参考文献数

18

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Cellular responses, such as cell fate decision and hormonal regulations, can be regulated by distinct temporal patterns of signaling molecules. However, how temporal patterns of signaling molecules determine the cellular responses remains largely unknown. Recently, we have proposed the concept of “temporal coding”, by which a single molecular species can encode multiple information through its temporal patterns. We found that signaling pathways can process information of stimulation patterns depending on their network motif and kinetics, and cells can regulate downstream molecules depending on stimulation pattern. Thus, “temporal coding” appears to serve as an information-embedding strategy to elicit specific cellular responses.

著者

ウィロックス ラルフ 河村 彰星 内田 慎一 山本 智 沖野 友哉 黒田 真也

出版者

東京大学大学院理学系研究科・理学部

雑誌

東京大学理学系研究科・理学部ニュース

巻号頁・発行日

vol.43, no.2, pp.15-17, 2011-07

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「可積分系」/「PとNP」/「臨界温度と秩序パラメータ」/「星間分子雲」/「アト秒パルス」/「システム生物学」

著者

小西 克巳 土屋 貴穂 国田 勝行 藤井 雅史 宇田 新介 黒田 真也

出版者

システム制御情報学会

雑誌

システム制御情報学会研究発表講演会講演論文集

巻号頁・発行日

vol.60, 2016-05-25

著者

浦久保 秀俊 黒田 真也 相原 威

出版者

日本シミュレーション学会

雑誌

シミュレーション (ISSN:02859947)

巻号頁・発行日

vol.25, no.1, pp.4-12, 2006-03-15

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Recent advance in neuroscience has revealed that neurons as information processors are not point nodes, but spatially distributed units, as represented by dendritic arborization. Computer simulation is very effective for analyzing the distributed properties of neurons; however, the implementation as computer programs is quite complicated. Here, we introduce the GENESIS and NEURON simulators, which have been developed for supporting such complex neuronal simulations. We firstly address the mathematical bases for modeling spatial properties of neurons, and then explain how the NEURON/GENESIS simulator handles the properties with sample programs. At last, we show the effectiveness of the simulators by introducing our computational researches about spike timing-dependent plasticity (STDP).

著者

黒田 真也 広報誌編集委員会 加藤 千恵 平岡 秀一 須藤 靖

出版者

東京大学大学院理学系研究科・理学部

雑誌

東京大学理学系研究科・理学部ニュース

巻号頁・発行日

vol.41, no.3, pp.3-6, 2009-09

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生物情報科学科、起動!/「連載:理学のキーワード」が単行本化!この9月に出版/参加者数3300人を記録した理学部オープンキャンパス2009/理学部オープンキャンパスあれこれ/ガリレオが見た宇宙、見なかった宇宙~世界天文年・七夕講演会~