RT @ShojiHashimoto3: 日本物理学会誌は宝の山。「モンテカルロ法は非常に悪い。他がすべてダメな場合に限り使うべし」 https://t.co/gOlwQoGNg0 ランダムウォークは見るからに効率が悪い。行ってほしい方向にわざと流す方法があればいいのに。そんな…

@Makegoodbetter http://t.co/W5JBoaWJ だよ。

RT @hashimoto_riken: 芥川賞うんぬんより、この物理学会誌の文章を良くよみなはれ、全国の大学／研究所スタッフ．円城塔「ポスドクからポストポスドクへ」 http://t.co/tIiiPMgW

最近のうちのラボの主な研究プロジェクトである、クライオ電子顕微鏡のための構造モデリングの日本語の総説です。主な手法を網羅していますので見てみてください。 Japanese review of our cryo-EM tools. 「クライオEMにおける生体分子構造のモデル評価とモデリング手法」https://t.co/oRaOw6QBZQ https://t.co/q3UUezrID6

総説2編目は、パデュー大・寺師さんらによる「クライオEMにおける生体分子構造のモデル評価とモデリング手法」です。発展著しいクライオ電子顕微鏡とその解析のための計算科学の手法を解説いただきました。https://t.co/LK5GSnJhdS

日経サイエンス今月号の「タンパク質を語る言語（出村政彬さん）」の「もっと知るには‥」でJSBi Bioinformatics Reviewの記事 https://t.co/lgvaldHUXp を参照してる！

タンパク質の言語モデル。せっかくだから作ってみたい感はある。 https://t.co/uYPeET3bdn

生きものが機械でもいいじゃない https://t.co/OiuHS4D2nk

J-STAGE Articles - 起業，新しい挑戦こそが不老の薬 https://t.co/lgp0vRUyCG フリーで読めます。

タンパク質言語モデルのよいレビューをみつけた。最高じゃん。https://t.co/RcQZ3h24P1

タンパク質の言語モデル https://t.co/3tG06ZRnlG

総説1編目は、東大・山口さんらによる「タンパク質の言語モデル」です。大規模言語モデルが世間を賑わしていますが、言語モデルの応用は自然言語処理にとどまりません。本稿ではタンパク質に対しても言語モデルが利用でき、かつそのポテンシャルを解説いただきました。https://t.co/8cdjtV2MjV

「COVID-19パンデミック下におけるウイルスゲノム疫学の発展」を東京大学 伊東潤平先生 @jampei2 と執筆し、JSBi Bioinformatics Review @npoJSBi に掲載していただきました。大規模シークエンス時代におけるウイルス学と生命情報科学の融合を考えるきっかけとなれば幸いです！https://t.co/ZcvRAYTvQd

というわけで，単純に対応表を引くだけでは計算量的に無理だから，もし中国語の部屋ができたら，知的処理があったといっていいんではないかとか，そんな話題とか載ってるAI学会誌の記事を貼っておく https://t.co/fZMSRDEFsK

標的タンパク質の構造情報のみから結合タンパク質の設計が可能になった https://t.co/rJbVbq9QZy ファルマシア誌のトピックスにCao L. et al., Nature 2022 "Design of protein-binding proteins from the target structure alone" https://t.co/fMHPpiKy41 を紹介する日本語の記事を書きました。

生物工学会誌の創立100周年記念企画「機械学習とバイオテクノロジー」に寄稿しました。「深層学習によるタンパク質の機能予測と設計」と題して、タンパク質工学における言語モデル、配列探索、構造と配列の同時探索（ハルシネーション）などについて書きました。 https://t.co/ZvILM6sUDY

How evolution builds up complexity? https://t.co/FHAILPg5QP I with @Nori_Ichihashi wrote about in vitro Darwinian evolution to probe evolvability of molecules. Take a look if you are interested in how to evolve a simple molecular system toward biological complexity.