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Kichi (@kichi_hrs)

投稿一覧（最新100件）

1180 0 0 0 OA 育児休業のすすめ:ニューヨークで専業主夫になった物理学者

RT @fgksk: 昔から何かと凄かった研究室の一つ上の大先輩がめちゃくちゃ面白くてためになる記事を書かれてます。とにかく文才がすごい(語彙力なくてすみません)。子育て研究者はご一読を「育児休業のすすめ：ニューヨークで専業主夫になった物理学者」: https://t.co/H…

22 0 0 0 OA 低温電子顕微鏡単粒子解析法による高分解能構造解析

RT @biochem_fan: 日本結晶学会誌「低温電子顕微鏡単粒子解析法による高分解能構造解析」https://t.co/yPUXXxtRZJ 2018 年の総説の続編。SPA が原子分解能に到達するまでのハードウェアとソフトウェアの進展を紹介。

22 0 0 0 OA 低温電子顕微鏡単粒子解析法による高分解能構造解析

低温電子顕微鏡単粒子解析法による高分解能構造解析 https://t.co/eS1rRK9OA0

9 0 0 0 OA Servalcatによるクライオ電子顕微鏡単粒子解析の構造精密化とマップ計算

Servalcatによるクライオ電子顕微鏡単粒子解析の構造精密化とマップ計算 https://t.co/aIgVIwvkso

53 0 0 0 5'-イノシン酸と5'-グアニル酸のうま味の発見

RT @sugargroove: 農芸化学界隈の人なら、なぜヤマサがシュードウリジン作ってるか分かる。関東支部参与会で何度かお話ししたことがある。 5’-イノシン酸と5'-グアニル酸のうま味の発見 國中 明 ヤマサ醤油(株)研究開発本部 化学と生物 47(4), 283-28…

22 0 0 0 OA エンドセリンB型受容体の結晶構造と活性化機構の解明

RT @sugargroove: 志甫谷渉 @shihoya1 さんの記事にはグッときた。和文総説では、みんなもっと苦労話とか裏話を書いたらいいよ。 すごい研究成果を出す人は超人のように思えてくるけど、当然ながら、みんな、普通の人、なんだよね。 @t2438 さんや幾多の恩師へ…

17 0 0 0 OA 低温電子顕微鏡による単粒子解析法の最前線

RT @YongChan_zzz: MRC分子生物学研究所の中根さんによる単粒子解析法の解説。訳語にこだわった「物理の教科書」的な文章が大変気持ち良いです。ぜひ今後も日本語で解説、ひいては教科書を書いていただきたいところです。 https://t.co/JYPcQd2M5u

115 0 0 0 OA 植物ウイルス病に関するもっとも古い記録とみられる万葉集の歌について

RT @biochem_fan: さきほど RT した geminivirus の構造論文 https://t.co/BjKrCQjt5U、冒頭で万葉集の孝謙天皇の歌が紹介されており、世界最古(752)の植物ウィルスの記載とある。この歌とは「この里は継ぎて霜や置く夏の野に我が見…

お気に入り一覧（最新100件）

9 0 0 0 OA 電子顕微鏡発達史

電子顕微鏡を発明したRuskaが書いた「電子顕微鏡発達史」の和訳 PDF → https://t.co/acYFSdZYGB https://t.co/2riB1eF0Tr

18 0 0 0 https://webview.isho.jp/journal/detail/abs/10.11477/mf.2425201798

https://t.co/KvLKtmWDPT FKBP-FRPなどの細胞膜移行システムを利用している研究者への朗報です。SLIPTシステムなら、ワンプラスミドで細胞膜へ分子を動かせます。Ras, PI3Kなどの活性化が簡便になりました。日本語の実験解説です！#SLIPT　#生体の科学

3 0 0 0 OA 呼吸鎖酵素に隠された新規アロステリーが導く特異的抗菌薬の創出

生物物理学会誌 「呼吸鎖酵素に隠された新規アロステリーが導く特異的抗菌薬の創出」https://t.co/ornM1YpC5Z 日本でもこういう in silico と in vitro スクリーニング・構造解析・MD 計算などを連携させた研究をできる人がいることに驚いた。

18 0 0 0 OA クライオEMにおける生体分子構造のモデル評価とモデリング手法

最近のうちのラボの主な研究プロジェクトである、クライオ電子顕微鏡のための構造モデリングの日本語の総説です。主な手法を網羅していますので見てみてください。 Japanese review of our cryo-EM tools. 「クライオEMにおける生体分子構造のモデル評価とモデリング手法」https://t.co/oRaOw6QBZQ https://t.co/q3UUezrID6

62 0 0 0 OA AlphaFoldによるタンパク質立体構造予測(実践編)

生物工学会誌2023年8月号に、「AlphaFoldによるタンパク質立体構造予測（実践編）」を寄稿しました。 https://t.co/ujK0nXSCPf 先月号の富井先生の「基礎編」と合わせて、ぜひご覧ください！https://t.co/x6nKpLKCPG

13 0 0 0 OA Why we are made of proteins and nucleic acids: Structural biology views on extraterrestrial life

[Review Article (Invited)] Why we are made of proteins and nucleic acids: Structural biology views on extraterrestrial life https://t.co/0iTgYh2bIQ 面白い。

47 0 0 0 OA タンパク質の言語モデル

総説1編目は、東大・山口さんらによる「タンパク質の言語モデル」です。大規模言語モデルが世間を賑わしていますが、言語モデルの応用は自然言語処理にとどまりません。本稿ではタンパク質に対しても言語モデルが利用でき、かつそのポテンシャルを解説いただきました。https://t.co/8cdjtV2MjV

44 0 0 0 OA グレリンの発見についての裏話

児島将康先生の『グレリンの発見についての裏話』って記事は、生物系で研究やったりする人は一度読んどくと良いかもしれませんね　https://t.co/TlSU61e3G3

1180 0 0 0 OA 育児休業のすすめ:ニューヨークで専業主夫になった物理学者

昔から何かと凄かった研究室の一つ上の大先輩がめちゃくちゃ面白くてためになる記事を書かれてます。とにかく文才がすごい(語彙力なくてすみません)。子育て研究者はご一読を「育児休業のすすめ：ニューヨークで専業主夫になった物理学者」: https://t.co/Hxg1SBMs6K

1 0 0 0 OA キャリアデザイン談話室(15) 好きなことを仕事にする

生物物理学会誌「キャリアデザイン談話室 (15) 好きなことを仕事にする」https://t.co/FALBzukYPe 楽しんでるのが伝わってきて好印象。

56 0 0 0 OA 深層学習を用いた構造モデリングと評価,その最近の展開

AlphaFold2の登場で深層学習による構造モデリングの有用性が広く知られるようになりました。そうした発展を学べる日本語で書かれた総説で、AlphaFold2の原理と限界についても解説されています。 https://t.co/z4gNd22fSd

6 0 0 0 OA 創薬研究におけるX線結晶学の強み

日本結晶学会誌「創薬研究における X 線結晶学の強み」https://t.co/FewhcGjN9Q 以前、臨床系の人から「構造生物学の人は創薬に役立つとアピールするが、実際には薬につながってないですよね」と言われたことがあるが、今度そう言われた時の返答のヒントとして参考になった。 ただ全体的に日本語が変。

3 0 0 0 OA アミノ酸を指定する遺伝暗号の構造の解明

西村暹先生はKhorana博士のもとで合成DNAからin vitroで作ったRNAをもとにしたコドン暗号の解読に多大な貢献をされています。 1966年に生物物理に書かれた日本語の総説にその詳細が書かれています。 https://t.co/Tsw1HQcCMj

334 0 0 0 OA 「スイーツや料理をおいしく感じる」科学

この7月から週2回ほど元ボスにラボに来てもらっているが、その際に講義の内容などについて話すことが多い。その際、元ボスから聞いた「果物はなぜ冷やすと甘いか」という話がとても面白い。こちらの総説の解説が分かりやすい。このネタ、2年生向け生化学の講義に取り入れよう https://t.co/tlh2cSS8bu

1 0 0 0 OA キャリアデザイン談話室(10) 物理/化学/生物と迷う日々

生物物理学会誌「キャリアデザイン談話室(10) 物理/化学/生物と迷う日々」https://t.co/y1IqvL8hO9 物理分野の聞いたことない話題ばかり言及されていて読みづらかった。単純な模型で複雑な現象の要点を掴む物理の美学と、現実に近い記述を追求する化学(や生物)の思想の対立は、とりさんもよく感じる。

9 0 0 0 OA Servalcatによるクライオ電子顕微鏡単粒子解析の構造精密化とマップ計算

日本結晶学会誌「Servalcat によるクライオ電子顕微鏡単粒子解析の構造精密化とマップ計算」https://t.co/W24Fly8rDQ 電顕マップの sigma 値は box size に依存してしまうから、論文の図で ○ sigma と書く時は注意が必要という指摘は、言われてみればそうだが、気づかずにいた。

22 0 0 0 OA 低温電子顕微鏡単粒子解析法による高分解能構造解析

日本結晶学会誌「低温電子顕微鏡単粒子解析法による高分解能構造解析」https://t.co/yPUXXxtRZJ 2018 年の総説の続編。SPA が原子分解能に到達するまでのハードウェアとソフトウェアの進展を紹介。

45 0 0 0 OA 計測・解析技術の進歩とサイエンス

生物物理学会誌「計測・解析技術の進歩とサイエンス」https://t.co/fN312X6eGS 測定機器や解析ソフトウェアのブラックボックス化に対する懸念。同意。

3 0 0 0 OA 透過型電子顕微鏡用カメラの基礎と技術動向

顕微鏡「透過型電子顕微鏡用カメラの基礎と技術動向」https://t.co/EinJF43Mw0 Gatan の人による解説。 CCD の黎明期には直接検出だったのがダイナミックレンジ等の問題で間接検出になり、CMOS の登場で直接検出が実用的になったのか。

16 0 0 0 OA KEKの共同利用型クライオ電子顕微鏡の利用方法

日本結晶学会「KEK の共同利用型クライオ電子顕微鏡の 利用方法」https://t.co/WxaXQNd1x9 電顕の経験がない状況で、ここまでユーザフレンドリな形で共同利用の仕組みを立ち上げたのは大したものだと思う。4 節のサンプル最適化のコツも有用。 Falcon4 導入によるスループット向上で今後も期待できる。

53 0 0 0 5'-イノシン酸と5'-グアニル酸のうま味の発見

農芸化学界隈の人なら、なぜヤマサがシュードウリジン作ってるか分かる。関東支部参与会で何度かお話ししたことがある。 5’-イノシン酸と5'-グアニル酸のうま味の発見 國中 明 ヤマサ醤油(株)研究開発本部 化学と生物 47(4), 283-285, 2009 https://t.co/c6KK2TBb0a

6 0 0 0 OA キャリアデザイン談話室(7) キャリアデザインって何だっけ?

『特に入門者向け光ピンセット製品である光ピンセット EDUユニット（約 34 万円）と弾性率モニタキット（約 23万円）は，価格設定が安すぎること（従来製品の 17%未満）が物議を醸したが』 https://t.co/oJXCwsVqci

5 0 0 0 OA クライオ電子顕微鏡で生体分子の構造解析をはじめよう

日本結晶学会誌「クライオ電子顕微鏡で生体分子の構造解析をはじめよう」https://t.co/qKGwlsGrCD 同じ号のもう一つの入門記事と違って、こちらは引っかかる点が多数。「結晶」学会なので、きちんとした査読ができる人が少ないのかしら。以下、詳細。

3 0 0 0 OA クライオ電子顕微鏡単粒子解析の実際~試料調製から画像解析まで~

日本結晶学会誌「クライオ電子顕微鏡単粒子解析の実際 ～試料調製から画像解析まで～」https://t.co/aH5wzmeZyv グリッドづくりやスクリーニングの重要性が詳述されており、良い解説となっている。

1 0 0 0 OA タンパク質結晶化に応用可能な新規小型抗体フォーマットFv-claspの開発

日本結晶学会誌「タンパク質結晶化に応用可能な新規小型抗体フォーマット Fv-clasp の開発」https://t.co/rybl3I1AvD VC と VL を antiparallel helix bundle でつなぎ、S-S 結合も導入して、従来の Fv より安定化。結晶化シャペロンとして役立つことも実証。賢い。SPA にも応用中とのことで、楽しみ。

20 0 0 0 OA キャリアデザイン談話室(6) キャリアデザイン談話できません!

生物物理「キャリアデザイン談話室(6) キャリアデザイン談話できません!」山下敦子(岡山大。甘味受容体などの構造生物学) https://t.co/RIl39YXX06 このエッセイの雰囲気がなんとなく好き。

7 0 0 0 OA SARS-CoV-2タンパク質構造モデルによる薬剤候補予測

生物物理学会誌「SARS-CoV-2タンパク質構造モデルによる薬剤候補予測」https://t.co/WvfXWwv9dN うーん、有望なのは見つかっていない印象……

7 0 0 0 OA 酵素のダイナミクスは酵素反応の理解に重要か?

生物物理学会誌「酵素のダイナミクスは酵素反応の理解に重要か?」https://t.co/EnONI6eJO0 面白かった。酵素が基底状態からゆらいで反応 ready な状態になってから、一気に進む。

2 0 0 0 OA 構造生物学の毒性への応用 - ADMETox関連蛋白質の構造解析連携

武田の人が話すのか、この内容とかかな？ https://t.co/vn015KLgyt

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