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  3. Tominaga K. (tomiken)

Tominaga K. (tomiken) (@pacyc1841)

投稿一覧（最新100件）

18 0 0 0 OA Domain-level Identification of Single Prokaryotic Cells by Optical Photothermal Infrared Spectroscopy

» Domain-level Identification of Single Prokaryotic Cells by Optical Photothermal Infrared Spectroscopy https://t.co/rWAkx6tZHT

33 0 0 0 OA Light-driven Proton Pumps as a Potential Regulator for Carbon Fixation in Marine Diatoms

» Light-driven Proton Pumps as a Potential Regulator for Carbon Fixation in Marine Diatoms https://t.co/goMtuHsPfg

22 0 0 0 OA A Fast and Easy Method to Co-extract DNA and RNA from an Environmental Microbial Sample

RT @yokadzaki: Our new paper has been published! We wish this will be one of the primally options when extracting nucleic acids from microb…

10 0 0 0 OA Identification of a Functionally Efficient and Thermally Stable Outward Sodium-Pumping Rhodopsin (BeNaR) from a Thermophilic Bacterium

» Identification of a Functionally Efficient and Thermally Stable Outward Sodium-Pumping Rhodopsin (<i>Be</i>NaR) from a Thermophilic Bacterium https://t.co/1oQaLZwHky

141 0 0 0 OA 生物多様性と文化へと繋がるバイオインフォマティクス

» 生物多様性と文化へと繋がるバイオインフォマティクス https://t.co/o4j46MVN8L

9 0 0 0 OA 深層学習によるタンパク質の機能予測と設計

» 深層学習によるタンパク質の機能予測と設計 https://t.co/aEBuJD0x0B

153 0 0 0 OA AlphaFold2までのタンパク質立体構造予測の軌跡とこれから

» AlphaFold2までのタンパク質立体構造予測の軌跡とこれから https://t.co/1Z8vn5CuUn

7 0 0 0 OA Novel Cross-domain Symbiosis between Candidatus Patescibacteria and Hydrogenotrophic Methanogenic Archaea Methanospirillum Discovered in a Methanogenic Ecosystem

» Novel Cross-domain Symbiosis between <i>Candidatus</i> Patescibacteria and Hydrogenotrophic Methanogenic Archaea <i>Methanospirillum</i> Discovered in a Methanogenic Ecosystem https://t.co/JJX9cnFowy

4 0 0 0 OA Eukaryotic Microbial RNA Viruses—Acute or Persistent? Insights into Their Function in the Aquatic Ecosystem

Eukaryotic Microbial RNA Viruses—Acute or Persistent? Insights into Their Function in the Aquatic Ecosystem https://t.co/X5D2Aj8hBA

82 0 0 0 OA 機能未知遺伝子の機能を推測するバイオインフォマティクス: AlphaFoldから遺伝子誕生学へ

機能未知遺伝子の機能を推測するバイオインフォマティクス： AlphaFoldから遺伝子誕生学へ https://t.co/Sd0RqR1Zmp

9 0 0 0 OA Development of a high-throughput field phenotyping rover optimized for size-limited breeding fields as open-source hardware

Development of a high-throughput field phenotyping rover optimized for size-limited breeding fields as open-source hardware https://t.co/XAmNFdadB1

2 0 0 0 OA RNA Virosphere in a Marine Zooplankton Community in the Subtropical Western North Pacific

RNA Virosphere in a Marine Zooplankton Community in the Subtropical Western North Pacific https://t.co/xMe3XCgzu0

277 0 0 0 OA 分子系統解析の最前線

» 分子系統解析の最前線 https://t.co/NdxhFB1KIo

9 0 0 0 OA Nitrogen-fixing Ability and Nitrogen Fixation-related Genes of Thermophilic Fermentative Bacteria in the Genus Caldicellulosiruptor

Nitrogen-fixing Ability and Nitrogen Fixation-related Genes of Thermophilic Fermentative Bacteria in the Genus Caldicellulosiruptor https://t.co/1WlciqwrKj

6 0 0 0 OA RNA Viral Metagenome Analysis of Subnanogram dsRNA Using Fragmented and Primer Ligated dsRNA Sequencing (FLDS)

RNA Viral Metagenome Analysis of Subnanogram dsRNA Using Fragmented and Primer Ligated dsRNA Sequencing (FLDS) https://t.co/mWHoopEiYd

18 0 0 0 OA Bacterium Lacking a Known Gene for Retinal Biosynthesis Constructs Functional Rhodopsins

Bacterium Lacking a Known Gene for Retinal Biosynthesis Constructs Functional Rhodopsins https://t.co/zntZESgCD3

3 0 0 0 OA Differential Responses of a Coastal Prokaryotic Community to Phytoplanktonic Organic Matter Derived from Cellular Components and Exudates

» Differential Responses of a Coastal Prokaryotic Community to Phytoplanktonic Organic Matter Derived from Cellular Components and Exudates https://t.co/Fr2eSDsAh8

3 0 0 0 OA EDTA-FISH: A Simple and Effective Approach to Reduce Non-specific Adsorption of Probes in Fluorescence in situ Hybridization (FISH) for Environmental Samples

EDTA-FISH: A Simple and Effective Approach to Reduce Non-specific Adsorption of Probes in Fluorescence <i>in situ</i> Hybridization (FISH) for Environmental Samples https://t.co/w6XCRZuwdT

9 0 0 0 OA Viral RNA Genomes Identified from Marine Macroalgae and a Diatom

Viral RNA Genomes Identified from Marine Macroalgae and a Diatom https://t.co/PC0CEsv8UH

19 0 0 0 OA Size Matters: Ultra-small and Filterable Microorganisms in the Environment

Size Matters: Ultra-small and Filterable Microorganisms in the Environment https://t.co/QhFUdtgDEH

1 0 0 0 OA Regulation of the heat shock response in Escherichia coli: history and perspectives

» Regulation of the heat shock response in<i> Escherichia coli</i>: history and perspectives https://t.co/PnxRionnxJ

お気に入り一覧（最新100件）

1 0 0 0 OA Effects of Co-existing Heterotrophs on Physiology of and Nitrogen Metabolism in Autotrophic Nitrite-oxidizing Candidatus Nitrotoga

J-STAGE Articles - Effects of Co-existing Heterotrophs on Physiology of and Nitrogen Metabolism in Autotrophic Nitrite-oxidizing <i>Candidatus</i> Nitrotoga https://t.co/kDLzdvljwc

277 0 0 0 OA 分子系統解析の最前線

RTで知ったこちら、 分子系統解析について基礎から最前線まで、本当にとてもよくまとめられていると思います。 図９には系統樹推定手法の選択指針も載っていますし、表２には系統解析ソフトウェア一覧も。勉強になります。 J-STAGE Articles - 分子系統解析の最前線 https://t.co/U5DihkKPCS

11 0 0 0 OA De novo設計ナノポアの創製

特集 ナノポア応用研究の最前線「De novo設計ナノポアの創製」新津 藍https://t.co/e5Q96IZPP0

4 0 0 0 OA A novel mode of interaction between intrinsically disordered proteins

天然変性タンパク質の相互作用の総説 タンパク質の折りたたみに係る静電相互作用の話から、天然変性タンパク質がなぜ相互作用相手がいないと決まった構造を取らないか概説した後、最近とある転写因子で見つかった相互作用しても構造を取らない例が紹介されている #BNTNJC https://t.co/AoFzrPeaRK

21 0 0 0 OA Why we are made of proteins and nucleic acids: Structural biology views on extraterrestrial life

生物はなぜタンパク質と核酸を構成因子とするのか？に関する総説 構造生物学的な観点から生体機能分子に成り得る分子の制約を考えた際、核酸であるDNAに情報を蓄積し、ペプチド鎖でできたタンパク質で様々な機能を果たす系は生物にとってかなりリーズナブルとのこと #BNTNJC https://t.co/nrX7x6zcOH

7 0 0 0 OA バイオものづくり 成功のためのコンパス

生物工学会誌にて、biBiomeのバイオものづくり事業や研究環境について紹介させていただきました。特にスタートアップでの研究に興味がある方に、どんな会社か知ってもらえたら嬉しいです！ https://t.co/v5OxFbni9G

27 0 0 0 OA Deep Subseafloor Biogeochemical Processes and Microbial Populations Potentially Associated with the 2011 Tohoku-oki Earthquake at the Japan Trench Accretionary Wedge (IODP Expedition 343)

そして何より現時点で世界の最も深い場所（海面から6900mの水深と800mのコアを合わせて7700mの深さ）から分離された化学合成微生物＝酢酸菌（Acetobacterium）は可愛いし凄いンゴ。 https://t.co/mw8OEuR9nd

33 0 0 0 OA Light-driven Proton Pumps as a Potential Regulator for Carbon Fixation in Marine Diatoms

Our paper investigating the physiological role of diatom rhodopsin has been published! - Light-driven Proton Pumps as a Potential Regulator for Carbon Fixation in Marine Diatoms https://t.co/kPFPClxlYR

33 0 0 0 OA Light-driven Proton Pumps as a Potential Regulator for Carbon Fixation in Marine Diatoms

珪藻の持つロドプシンの生理的役割を調べた論文が出版されました（Microbes Environ）！ Light-driven Proton Pumps as a Potential Regulator for Carbon Fixation in Marine Diatoms https://t.co/kPFPClxlYR

32 0 0 0 OA COVID-19パンデミック下におけるウイルスゲノム疫学の発展

早稲田大学の川崎純菜さんと、ウイルスゲノム疫学についての総説を執筆し、JSBi Bioinformatics Review @npoJSBi に上梓しました。 G2P-Japanで行った、SARS-CoV-2次期流行株の超早期予測と、進化パターンの解析について書いています。 オープンアクセスです、ぜひご一読を！ https://t.co/QPNyf86Xs2 https://t.co/tw2strxENd

32 0 0 0 OA 物理屋のための深層学習

日本物理学会誌は宝の山。私には一番しっくりくる機械学習の解説。https://t.co/jtrJzklULk 結局は大規模なフィットの問題で、いつもやるように勾配降下法を使う。データを部分に分けて順番に最適化する作戦も。全データを同時に使うと進みが遅くなる。高次元ランダムウォークの問題。親近感ありあり。

1744 0 0 0 OA 日本語からはじめる科学・技術英文の書き方

日本物理学会誌は宝の山。これ読みたい。 https://t.co/T0ueG5zGGZ 「削除しても文意の変わらない語句は全て冗長」。誇張語の使用は「野心に満ちた若い科学・技術者が初めて成功を経験した場合に使いやすい表現」。SNSは悪文であふれている。その倍は良文をよむべし。

277 0 0 0 OA 分子系統解析の最前線

分子系統解析についての日本語レビュー　系統解析に使用すべきプログラムなども多数紹介されており、大変参考になるhttps://t.co/CRBp1ASkgi

3 0 0 0 OA 日本海溝の深海微生物による炭酸暗固定

この航海で、日本海溝の微生物による二酸化炭素の取り込みを調べた論文がこれのようです。 ゾベル先生との共著論文。 Seki and ZoBell 1967 https://t.co/zhWh4ct157 https://t.co/PGMRSe3FWz

22 0 0 0 OA A Fast and Easy Method to Co-extract DNA and RNA from an Environmental Microbial Sample

岡崎先生を筆頭著者とするDNA/RNA同時抽出プロトコルの論文がM&Eに掲載されました！https://t.co/DnYYU6O3kJ

22 0 0 0 OA A Fast and Easy Method to Co-extract DNA and RNA from an Environmental Microbial Sample

Our new paper has been published! We wish this will be one of the primally options when extracting nucleic acids from microbial samples: A Fast and Easy Method to Co-extract DNA and RNA from an Environmental Microbial Sample https://t.co/0vf3gtfr2E

4 0 0 0 OA Eukaryotic Microbial RNA Viruses—Acute or Persistent? Insights into Their Function in the Aquatic Ecosystem

Eukaryotic Microbial RNA Viruses—Acute or Persistent? Insights into Their Function in the Aquatic Ecosystem https://t.co/tJagoLelCC

418 0 0 0 OA 日本の地理学は『銃・病原菌・鉄』をいかに語るのか―英語圏と日本における受容過程の比較検討から―

“しかしながら，本書は英語圏では地理学者をはじめ学術界から数々の強い批判を受けてきたのに対し，日本では多方面から称賛されており，また地理学者による発信は皆無に近い” / “日本の地理学は『銃・病原菌・鉄』をいかに語るのか―英語圏と日本における受容過程の比較検討…” https://t.co/nMSTHnnG8l

96 0 0 0 OA Phenotypic systems biology for organisms: Concepts, methods and case studies

論文が出ました Phenotypic systems biology for organisms: Concepts, methods and case studies 表現型システム生物学：概念、方法、ケーススタディ https://t.co/WAYmUQnYf3 遺伝子中心のシステム生物学を、表現型（形態、行動、生活史など）に拡張する野心的な試みです。新分野の創出を目論みます https://t.co/JC8nJpfuQr

48 0 0 0 OA 薬学・科学で用いられる英単語の接尾語に関する基本的理解の試み

科学用語については、接頭辞や接尾辞などに精通し、英単語をいくつかに分解して理解すると良いと思っているが、こちらの二つのPDFには接頭辞と接尾辞がそれぞれまとまっていて素敵 https://t.co/3VIpPCYrTB https://t.co/uT8DnLlA2q

44 0 0 0 OA 薬学・科学に用いられる英単語の接頭語に関する基本的検討

科学用語については、接頭辞や接尾辞などに精通し、英単語をいくつかに分解して理解すると良いと思っているが、こちらの二つのPDFには接頭辞と接尾辞がそれぞれまとまっていて素敵 https://t.co/3VIpPCYrTB https://t.co/uT8DnLlA2q

1 0 0 0 OA アマモ根面における従属栄養細菌による窒素固定活性

Nitrogenase activity of heterotrophic bacteria associated with roots of eelgrass Zostera marina. Shieh et al 1989 https://t.co/6o3f0bHh9O

2 0 0 0 OA RNA Virosphere in a Marine Zooplankton Community in the Subtropical Western North Pacific

RNA Virosphere in a Marine Zooplankton Community in the Subtropical Western North Pacific https://t.co/EQq5EREl41

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