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hkane (@hkanekane)

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投稿一覧（最新100件）

16 0 0 0 OA 農研機構における育種情報インフラの整備と活用事例

「農研機構における育種情報インフラの整備と活用事例」 22年秋　育種学会のワークショップいちばん伝えたかったこと「手あたり次第にデータをためていくだけでは誰からも使われないデータの沼地となってしまう可能性がある.」メタデータの整備は大切 https://t.co/NJfPGm7GEg

1 0 0 0 OA スマート育種ツールの利用に関するワークショップ

「スマート育種ツールの利用に関するワークショップ」 22年秋の育種学会でのワークショップ育種情報管理支援システム「BRIMASS」系譜情報データベース「Pedigree Finder」有用遺伝子の品種間多型情報を整理した有用遺伝子カタログと可視化ツール「アリルグラフ」を紹介 https://t.co/pZTdQ2JDRT

3 0 0 0 OA 系譜情報グラフデータベース「Pedigree Finder」

「Pedigree Finder」の論文では、交配組み合わせの記載ルールの標準化についても記載しています Purdy et al.（1968）の記載方法を基にしており、論文の表1で公開しています種子親Aと花粉親Bの交配は A/B と記入します #breeding #FAIR https://t.co/7Yb84pS3y0

3 0 0 0 OA 系譜情報グラフデータベース「Pedigree Finder」

系譜情報グラフデータベース「Pedigree Finder」の原著論文は「育種学研究」から公開されています系譜情報を整備するために、語彙やデータフォーマットの統一を行うとともに，品種・系統の標準化されたIDの利用について詳しく記載しています #FAIR #RDF #breeding #Graph https://t.co/7Yb84pS3y0

1 0 0 0 OA RAD-R scripts: R pipeline for RAD-seq from FASTQ files to linkage maps construction and run R/QTL, operating only at copying and pasting scripts into R console

RAD-R scripts: R pipeline for RAD-seq from FASTQ files to linkage maps construction and run R/QTL, operating only at copying and pasting scripts into R console https://t.co/cPoFhmRq8d

1 0 0 0 OA Collection, preservation and distribution of Oryza genetic resources by the National Bioresource Project RICE (NBRP-RICE)

Collection, preservation and distribution of Oryza genetic resources by the National Bioresource Project RICE (NBRP-RICE) https://t.co/N0M8rI3h0A

3 0 0 0 OA 日本山海名物図会 5巻

「天王寺干蕪」について、国会図書館のサイトで「日本山海名物図会」を調べた自宅で出来ることがすごいし、書誌情報も充実している https://t.co/dXanIyVeyL

301 0 0 0 OA 視点女性研究者のリアル:その1 出産育児と不妊治療

「子どもを産んだ自分を休ませることなく，研究者としての自分を見失わないためにたくさんの無理を重ねてきた」子育てだけでなく、介護も同じ状況なので、男性研究者の皆様も他人事ではない https://t.co/1fJz8fSE4p

4 0 0 0 OA Parental diagnosis of satsuma mandarin (Citrus unshiu Marc.) revealed by nuclear and cytoplasmic markers

柑橘の論文2つ核および細胞質マーカーによるウンシュウミカン(Citrus unshiu Marc.)の親子鑑定 https://t.co/daLXHTy3u9 こちらはタチバナやグレープフルーツ、ポンカンなど https://t.co/LxEqYvQy1U

13 0 0 0 Step out of your lab to the town-Considering current issues of science communications

RT @bonohu: プログラム集には載っていませんが #BMB2015 話します “[2F21] 研究室から街へ出よう-科学コミュニケーションの課題を考える- 2015年12月2日(水) 18:45 〜 20:15 第21会場 (神戸国際会議場 5F… https://t.…

220 0 0 0 OA PLOS ONEのこれまで,いま,この先

RT @orenotwitter: PLOS ONEのこれまで，いま，この先 http://t.co/rt24gPzrpE

36 0 0 0 OA 新しい日本語Webコンテンツ,「新着論文レビュー」と「領域融合レビュー」

RT @first_author: 「新着論文レビュー」と「領域融合レビュー」について紹介した記事が，『情報管理』2013年6月号に掲載されました．ぜひ，ご一読ください．http://t.co/MHQko10tS2

36 0 0 0 OA 新しい日本語Webコンテンツ,「新着論文レビュー」と「領域融合レビュー」

6 0 0 0 OA Complete Genome Sequence of Bradyrhizobium sp. S23321: Insights into Symbiosis Evolution in Soil Oligotrophs

RT @TogoAnnotation: TogoAnnotation (KazusaAnnotation)を用いてコミュニティゲノムアノテーションを実施したBradyrhizobium sp. S23321の論文、配列が公開されました。 http://t.co/JCKrt ...

6 0 0 0 OA Complete Genome Sequence of Bradyrhizobium sp. S23321: Insights into Symbiosis Evolution in Soil Oligotrophs

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2 0 0 0 OA 遺伝学から見たモチ性穀類の起源:モチの文化誌とモチの遺伝子

モチ性穀類の起源について　自分（２０１９） J-STAGE Articles - 遺伝学から見たモチ性穀類の起源：モチの文化誌とモチの遺伝子 https://t.co/S9Swb0vu1R

39 0 0 0 OA LASSOに対するSURE理論に基づく情報量規準

LASSOの正則化パラメータの選択には SURE（Stein's Unbiased Risk Estimate）から導出されるAICを使いましょう，という二宮さんからのメッセージ。数値例やAICの導出もあって分かりやすい。 https://t.co/HlRa27ZSgR

836 1 0 0 OA 審査のゆがみ:全日本吹奏楽コンクールを例に

グラントのヒアリングでも同じ問題がありそう。「審査のゆがみ：全日本吹奏楽コンクールを例に」https://t.co/0509IGqAhD

253 0 0 0 OA A New Genus of the Order Saxifragaceæ

矢田部先生（田邊教授のモデル）によるキレンゲショウマ (Kirengeshoma palmata Yatabe)の報告(1890)も英文で #植物学雑誌に掲載されています。 #あさドラらんまん #らんまん（資料リンク） https://t.co/vI3QgOccvI https://t.co/KaV09XgyLA

2 0 0 0 OA Anthocyanin and Flavones from the Flowers of Tripora divaricata (Lamiaceae) and their Contribution to Blue Violet Color

カリガネソウの青紫色の花の発色を調べました。美しい青紫色のアントシアニンが取れました。https://t.co/v1CxGzqvrX

3 0 0 0 OA 1. 植物の土壌からの有機的なリン酸吸収メカニズム

教えてくれた論文がこれ https://t.co/jOnIXAp9PG 自分？そんなこと言った覚えない。ボケたのか？ https://t.co/wTeM2tECPJ

2 0 0 0 OA ニホンナシの交雑育種における重要形質に関連したDNAマーカーの利用技術

ニホンナシの交雑育種における重要形質に関連した DNA マーカーの利用技術 https://t.co/vTJwD6Eyi7

2 0 0 0 OA サルビア・スプレンデンスおよびサルビア・コクシネア園芸品種の花色とアントシアニン

サルビアの花色研究の論文が公開になっていました。お疲れ様でした！サルビア・スプレンデンスおよびサルビア・コクシネア園芸品種の花色とアントシアニン https://t.co/yhZA1E14Ql

1 0 0 0 OA An Analytical Method for Simultaneous Measurement of Various Cyanotoxins Using Stable Isotope-Labeled Surrogates and a Microbial Flora Analysis to Assign Each Cyanotoxin to its Source

５種類のシアノトキシンの一斉分析に関する論文が出ました．この論文は先日の厚労省の委員会でも紹介されました https://t.co/tz07JWsqZ0

14 0 0 0 OA 植物の形態形成を操る微生物ファイトプラズマ

この時期よくみるポインセチアは、マイコプラズマ(ファイトプラズマ)感染のため、叢生（枝が短くなってどん詰まりの形）なのだそうだ。植物病理研の方に教わったトリビア。https://t.co/aFb3Rv7SdO https://t.co/qYpR8ZiDAY

1 0 0 0 OA Identification of a unique allele in the quantitative trait locus for crown root number in japonica rice from Japan using genome-wide association studies

We published a paper about identification of candidate genes for root number in rice. A unique haplotype that exists only in the famous Japanese variety Koshihikari and related varieties decreases root number. What does it mean? https://t.co/spUNj3oAeI

9 0 0 0 OA Development of a high-throughput field phenotyping rover optimized for size-limited breeding fields as open-source hardware

野外植物の自動測定用ローバーを開発大規模に画像を取得し、深層学習によってコムギの出穂を測定する手法を開発。JST CRESTの岩田チームとの課題間連携のおかげで新しい分野に展開できた。プレスリリース：https://t.co/YRdJEJVZFb 論文：https://t.co/dJVtjIzqM0 @JST_Kisokenkyu https://t.co/Zbc8gsAAf0

1 0 0 0 OA 晩生カンキツ‘不知火’

@nashiyasan 柑橘の「不知火」（商標　デコポン）に至っては「ぶっさいくだなw。これはないない。」と系適にもかけられることなく「どういうわけか」試験場から流出して広まっていたりします。 https://t.co/5fDtLH7eIu

5 0 0 0 OA デザイン無しの猪突猛進

当専攻の専攻長は生物工学会誌の「バイオ系のキャリアデザイン」で私的な情報をバリバリ出していくスタイル。奥様とは高校時代からお知り合いなのね（キャッ

5 0 0 0 OA 土壌調査から土壌物理性を診断する際の用語の整理—水田および水田転換畑を対象に—

誰でも読めるようになってたので、ご紹介。「硬盤」「耕盤」「すき床」は異なる意味の単語であり、「有効土層」と「作土層」も同様に異なる意味の単語ですよというお話。「土壌調査から土壌物理性を診断する際の用語の整理—水田および水田転換畑を対象に—」 https://t.co/wnWHIcxFZS

15 0 0 0 OA ジャパンサーチ利活用スキーマの設計と応用

ジャパンサーチ利活用スキーマの設計と応用 https://t.co/tpdsU9UeqK デジタルアーカイブ学会誌2020年第4号のジャパンサーチ特集に寄稿した記事が公開されました。統合ポータルのためのRDFモデル・語彙設計の考え方、検討過程、主要な構造について説明します

6 0 0 0 知識グラフ,セマンティックウェブを構成するRDFと問い合わせ言語SPARQL

本記事執筆しました。質問やご意見ありましたら私宛よろしくお願いします。 https://t.co/klWNqKC0Fv https://t.co/A8Z155jcmb

7 0 0 0 OA Mikan genome database (MiGD): integrated database of genome annotation, genomic diversity, and CAPS marker information for mandarin molecular breeding

カンキツのゲノムアノテーションとCAPSマーカー情報を提供するMikan Genome Database (MiGD)に関する論文が公開されました！色々と紆余曲折があったので、ようやく公開されてホッとしたけど、これからがこのDBの始まりです。 https://t.co/qqS3s7wVbt

6 0 0 0 OA 医薬品安全性評価のための肝毒性オントロジー構築とその応用

今回のICBO2019でも発表されていた，医薬基盤研の山縣さんの論文．オントロジーの構築から利用の一連の実践例を知りたい方に最適な１本だと思います．なお，ICBO2019での論文はこちら https://t.co/7OAI6jeDMZ https://t.co/ftTxwssZRm

4 0 0 0 レクチャーシリーズ:「人工知能の今」〔第3 回〕知識表現 ─オントロジー,知識グラフ─

レクチャーシリーズ：「人工知能の今」〔第3 回〕知識表現 ─オントロジー，知識グラフ─ https://t.co/MnIOSd9ugb #ontology #knowledgegraph

26 0 0 0 OA ゲノム情報全盛のいま使える分子系統解析のエッセンス

テクニカルノート「ゲノム情報全盛のいま使える分子系統解析のエッセンス」というのを少し前に出しました。PDFがフリーでとれるようになっていることに今気づいたのでここでお伝えしておきます。今ふと考えると、タイトル通りの内容になっているか、自信はありません。https://t.co/BqhXOIeI9G

3 0 0 0 OA ニホンナシ栽培品種の変遷と農研機構における品種育成の現状

私が学生の頃は北限は岩手とか学んだ気がしますが、今は沖縄以外ではつくられているらしい“日本のナシ生産量は世界で12 位…国内ではニホンナシが主要な栽培種であり…沖縄を除く全ての都道府県で栽培されている”／ニホンナシ栽培品種の変遷と農研機構における品種育成の現状 https://t.co/QTWcOwf9gJ

11 0 0 0 OA 投稿原稿種類「データ論文」の新設にあたって

“「JAMSTEC Report of Research and Development (JAMSTEC-R)」では2017年4月から，投稿原稿の新たな種類として「データ論文」を設ける。” / “投稿原稿種類「データ論文」の新…” https://t.co/RUCezerKYg

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16 0 0 0 OA 農研機構における育種情報インフラの整備と活用事例

1 0 0 0 OA スマート育種ツールの利用に関するワークショップ

3 0 0 0 OA 系譜情報グラフデータベース「Pedigree Finder」

3 0 0 0 OA 系譜情報グラフデータベース「Pedigree Finder」

1 0 0 0 OA RAD-R scripts: R pipeline for RAD-seq from FASTQ files to linkage maps construction and run R/QTL, operating only at copying and pasting scripts into R console

1 0 0 0 OA Collection, preservation and distribution of Oryza genetic resources by the National Bioresource Project RICE (NBRP-RICE)

3 0 0 0 OA 日本山海名物図会 5巻

301 0 0 0 OA 視点 女性研究者のリアル:その1 出産育児と不妊治療

4 0 0 0 OA Parental diagnosis of satsuma mandarin (Citrus unshiu Marc.) revealed by nuclear and cytoplasmic markers

13 0 0 0 Step out of your lab to the town-Considering current issues of science communications

220 0 0 0 OA PLOS ONEのこれまで,いま,この先

36 0 0 0 OA 新しい日本語Webコンテンツ,「新着論文レビュー」と「領域融合レビュー」

36 0 0 0 OA 新しい日本語Webコンテンツ,「新着論文レビュー」と「領域融合レビュー」

6 0 0 0 OA Complete Genome Sequence of Bradyrhizobium sp. S23321: Insights into Symbiosis Evolution in Soil Oligotrophs

6 0 0 0 OA Complete Genome Sequence of Bradyrhizobium sp. S23321: Insights into Symbiosis Evolution in Soil Oligotrophs

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2 0 0 0 OA 遺伝学から見たモチ性穀類の起源:モチの文化誌とモチの遺伝子

39 0 0 0 OA LASSOに対するSURE理論に基づく情報量規準

836 1 0 0 OA 審査のゆがみ:全日本吹奏楽コンクールを例に

253 0 0 0 OA A New Genus of the Order Saxifragaceæ

2 0 0 0 OA Anthocyanin and Flavones from the Flowers of Tripora divaricata (Lamiaceae) and their Contribution to Blue Violet Color

3 0 0 0 OA 1. 植物の土壌からの有機的なリン酸吸収メカニズム

2 0 0 0 OA ニホンナシの交雑育種における重要形質に関連したDNAマーカーの利用技術

2 0 0 0 OA サルビア・スプレンデンスおよびサルビア・コクシネア園芸品種の花色とアントシアニン

1 0 0 0 OA An Analytical Method for Simultaneous Measurement of Various Cyanotoxins Using Stable Isotope-Labeled Surrogates and a Microbial Flora Analysis to Assign Each Cyanotoxin to its Source

14 0 0 0 OA 植物の形態形成を操る微生物ファイトプラズマ

1 0 0 0 OA Identification of a unique allele in the quantitative trait locus for crown root number in japonica rice from Japan using genome-wide association studies

9 0 0 0 OA Development of a high-throughput field phenotyping rover optimized for size-limited breeding fields as open-source hardware

1 0 0 0 OA 晩生カンキツ‘不知火’

5 0 0 0 OA デザイン無しの猪突猛進

5 0 0 0 OA 土壌調査から土壌物理性を診断する際の用語の整理—水田および水田転換畑を対象に—

15 0 0 0 OA ジャパンサーチ利活用スキーマの設計と応用

6 0 0 0 知識グラフ,セマンティックウェブを構成するRDFと問い合わせ言語SPARQL

7 0 0 0 OA Mikan genome database (MiGD): integrated database of genome annotation, genomic diversity, and CAPS marker information for mandarin molecular breeding

6 0 0 0 OA 医薬品安全性評価のための肝毒性オントロジー構築とその応用

4 0 0 0 レクチャーシリーズ:「人工知能の今」〔第3 回〕知識表現 ─オントロジー,知識グラフ─

26 0 0 0 OA ゲノム情報全盛のいま使える分子系統解析のエッセンス

3 0 0 0 OA ニホンナシ栽培品種の変遷と農研機構における品種育成の現状

11 0 0 0 OA 投稿原稿種類「データ論文」の新設にあたって

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301 0 0 0 OA 視点女性研究者のリアル:その1 出産育児と不妊治療