著者
島田 武彦 白鳥 利治 羽山 裕子 西村 幸一 山口 正己 吉田 雅夫
出版者
園芸学会
雑誌
園芸学会雑誌 (ISSN:00137626)
巻号頁・発行日
vol.68, no.5, pp.984-986, 1999-09-15
被引用文献数
1

RAPD (Random amplified polymorphic DNA)法により, 56品種・系統のオウトウ・サクラの類縁関係を検討した.クラスター分析の結果, 供試材料は大きくオウトウ品種群, サクラ品種群に分かれ, 両者は遺伝的に類似性が低いことが確かめられた.中国オウトウ, Lithocerasus植物は日本在来のサクラと比較的類似性が低いことが確かめられた.
著者
草田 義昭 瀬尾 茂人 竹中 要一 野口 眞三郎 松田 秀雄
雑誌
研究報告バイオ情報学(BIO) (ISSN:21888590)
巻号頁・発行日
vol.2016-BIO-45, no.7, pp.1-6, 2016-03-11

遺伝子発現プロファイルの臨床応用は,近年精力的に研究が行われている.しかしマイクロアレイを用いたデータ解析においては,”バッチ効果” を取り除くことが不可欠であり,さらに逐次サンプルが追加される臨床現場では,1 サンプル毎に正規化が完結することが求められている.我々は,ノンパラメトリックZ標準化 (NPZ) 法を提案し,既存の手法と比較検討を行った.まず,公共のデータベースからエストロゲン受容体 (ER) とヒト上皮増殖因子受容体 2 (HER2) の免疫組織化学 (IHC) 染色の結果を有する 2,813 症例 (24 データセット) のマイクロアレイの発現データを抽出した.続いて,CEL ファイルからバックグランド補正及び,log2 変換のみを行ったもの (Raw), 既存の 4 つの正規化法 [Microarray Suite 5.0(MAS5),frozen robust multiarray analysis (fRMA),radius minimax (RMX)]. に対して,下記の 6 つの数値変換 [無変換,シングルアレイ数値変換(RANK,,Z,NPZ,,YuGene),マルチアレイ数値変換 (ComBat)] を加えて,各々の ER と HER2 の IHC 染色の結果と mRNA の発現の一致率を比較した.シングルアレイ数値変換を行うことで IHC 染色と mRNA の発現の一致率は改善した.一方で,マルチアレイ数値変換は,主成分分析ではバッチ効果を他の手法に比して除去しているように図示されたが,実際には IHC 染色との一致率が低下していた.さらに,乳癌の予後と数値変換の検討の結果,MAS5 後に NPZ を加えることで,無変換,マルチアレイ数値変換と比べて 2 群の差が明瞭となった.今回,我々は乳癌のデータセットを用いて数値変換の与える影響について検討を行った.シングルアレイ数値変換を追加することで,臨床における発現データのバッチ効果の除去に有効である可能性が示唆された.
著者
岸 国平 我孫子 和雄 高梨 和雄 矢野 龍
出版者
日本植物病理学会
雑誌
日本植物病理学会報 (ISSN:00319473)
巻号頁・発行日
vol.39, no.4, pp.288-296_2, 1973

1. 黄色網斑病はスモモのホワイトプラム,Methley, Burbank, Hungarian-prune, Red June, Beauty, Santa Rosa,大石早生などの品種およびサクラの染井吉野,孫普賢,嵐山,類嵐,関山などの品種に自然発生が認められた。<br>2. 本病は接木によってスモモおよびサクラから,モモ,ウメ,アンズ,スモモ,サクラ,オウトウなどに伝染した。<br>3. 本病はスモモおよびサクラではyellow vein net, yellow line pattern, chlorotic ring spot, chlorotic spotなどの症状を示し,モモ,アンズ,オウトウなどでは主としてline patternを,ウメではyellow vein netおよびline patternを生ずるとともに著しい萎縮症状を示した。<br>4. 本病罹病樹からは1種の汁液伝染性ウイルスが分離されたが,本ウイルスはキュウリの接種葉にlocal lesionを生ずるのみでGatjang,ペチュニア,<i>N. tabacum, N. megalosiphon, N. glutinosa, C. amaranticolor, C. quinoa</i>などFulton, Kirkpatrickらがplum line pattern virusの寄主として報告した植物に感染しなかった。<br>5. 本病およびリンゴモザイク病はともにクサボケに伝染し,きわめて類似した症状を示したが,本病はリンゴに感染せず,またリンゴモザイク病はモモに発病しなかった。
著者
[豊田天功] [著]
巻号頁・発行日
vol.[123], 1800
著者
大谷 吉秀 桜井 嘉彦 五十嵐 直喜 横山 剛義 木全 大 亀山 香織 久保田 哲朗 熊井 浩一郎 北島 政樹
出版者
一般社団法人 日本消化器外科学会
雑誌
日本消化器外科学会雑誌 (ISSN:03869768)
巻号頁・発行日
vol.31, no.4, pp.990-994, 1998 (Released:2011-08-23)
参考文献数
26

消化器癌の進展過程でのマトリックス分解酵素 (matrix metalloproteinase: MMP) による細胞外マトリックス (extracellular matrix: ECM) 破壊における間葉系細胞の役割について検討した.1型, III型コラーゲンを分解するMMP-1は癌先進部組織で高い酵素活性を示した.MMP-1産生細胞の同定を目的にin situ hybridizationを行った結果, 癌巣周囲の線維芽細胞や顆粒球にMMP-1mRNAの発現を認めた.ヒト胃粘膜由来線維芽細胞の培養液にヒト胃癌細胞株MKN-74の培養上清を添加すると, 単独培養に比べ高いMMP-1産生を認めた (p<0.05).また, ヒト胃癌細胞株TMK-1の腹腔内投与によるヌードマウス腹膜播種モデルでは, 癌細胞を線維芽細胞の培養上清とともに投与することで結節数の有意な増加を認めた (p<0.01).以上より, 消化器癌によるECM破壌に間葉系細胞が重要な役割を演じていることが確認された.
巻号頁・発行日
vol.第4冊, 1000
著者
Naoya Hirata Shigeru Yamada Yuko Sekino Yasunari Kanda
出版者
The Japanese Society of Toxicology
雑誌
The Journal of Toxicological Sciences (ISSN:03881350)
巻号頁・発行日
vol.42, no.2, pp.193-204, 2017-04-01 (Released:2017-03-17)
参考文献数
45
被引用文献数
7 26

Epidemiological studies suggest that lung cancer, which is a major cause of cancer death, has a critical association with cigarette smoking. Tobacco-specific nitrosamine 4-(methylnitrosamino)-1-(3-pyridyl)-1-butanone (NNK) in cigarette smoke is a major risk factor for carcinogenesis. However, the mechanisms by which NNK promotes cancer development have not been fully elucidated. Growing evidence suggests that lung cancer originates from cancer stem cells (CSCs), which are a minor population of lung cancer cells. In the present study, we investigated the effects of NNK on the CSCs in A549 human lung cancer cells using flow cytometry with aldehyde dehydrogenase (ALDH), a functional marker of CSCs. We found that NNK increased the proportion of ALDH-positive cells in a dose-dependent manner. A Wnt inhibitor PNU74654 reduced NNK-induced expression levels of Wnt target gene Dkk1 and increase in ALDH-positive cells. We next examined the signaling pathway that mediates the NNK-induced increase in ALDH-positive cells via Wnt signaling. DCF assay revealed that NNK induced reactive oxygen species (ROS) production. The ROS scavenger N-acetylcysteine (NAC) inhibited the NNK-induced Wnt activation and increase in ALDH-positive cells. These data suggest that NNK-induced ROS activate the Wnt signaling pathway in A549 cells. These findings would provide new insights into the role of NNK in the lung CSCs.
著者
日本数学会 編
出版者
誠文館等
巻号頁・発行日
vol.第2編(尋常第6学年用), 1912
著者
Yamada Hideyasu Hida Norihito Hizawa Nobuyuki
出版者
DOVE MEDICAL PRESS LTD
雑誌
International journal of chronic obstructive pulmonary disease (ISSN:11782005)
巻号頁・発行日
vol.13, pp.3141-3147, 2018-12
被引用文献数
5

Background: A large body of evidence suggests that long-acting β2-adrenoceptor agonist (LABA)/long-acting muscarinic antagonist (LAMA) combinations induce a strong synergistic bronchodilatory effect in human isolated airways. Moreover, a recent post hoc analysis demonstrated clinical synergism between LABAs and LAMAs, which induces a synergistic improvement not only in lung function but also in dyspnea in COPD patients.Aim: The aim of this study is to examine the baseline factors related to improvement in lung function or clinical symptoms that results from the administration of LAMA or LAMA/LABA and to compare the differences in improvement in lung function or clinical symptoms between LAMA and LAMA/LABA.Methods: Among 829 patients with COPD who were treated with LAMA or LAMA/LABA in our hospital, 112 patients (aged 40–89 years) matched the criteria. Of these 112 patients, 71 received LAMA (LAMA group) and 41 received LAMA/LABA (LAMA/LABA group) as the initial treatment. Various examination results such as lung function test values, symptom change, and frequency of exacerbations were compared between the two groups.Results: Compared with the monotherapy, the combination therapy significantly improved the FEV1, inspiratory capacity (IC), and total COPD assessment test (CAT) scores. Comparing the improvement in each domain of the CAT produced by the combination therapy with that of the monotherapy, larger improvements were found for the domains of going out and sleeping. The frequency of exacerbations during the 24 weeks was significantly lower in the combination therapy group than in the LAMA monotherapy group (P=0.034). Although no relationship was found between improvement in FEV1 and any pretreatment factors in the LAMA/LABA group, the improvement in the CAT score was strongly related to the baseline CAT score, smoking index, and air trapping index (P-value <1×10-4).Conclusion: In this study of clinical practice, we found that LAMA/LABA combination therapy improved the clinical symptoms of COPD and IC and that the effects of the combination therapy were consistent with those observed in previous clinical trials.
著者
Takayuki Toyama Tomotaka Kawayama Takashi Kinoshita Yohei Imamura Makoto Yoshida Koichiro Takahashi Kazuhiko Fujii Ikkou Higashimoto Tomoaki Hoshino
出版者
The Japanese Society of Internal Medicine
雑誌
Internal Medicine (ISSN:09182918)
巻号頁・発行日
pp.0488-17, (Released:2018-09-12)
参考文献数
37
被引用文献数
9

Objective This multicenter, cross-sectional, non-interventional trial aimed to investigate adherence barriers to inhaled medicines when compared with oral medicines in Japanese patients with chronic obstructive pulmonary disease (COPD) and asthma. Methods The self-reporting "Adherence Starts with Knowledge 20" (ASK-20) questionnaire was administered for adherence barriers of inhaled and oral medicines to outpatients with regular clinic attendance. Results Patients with COPD and asthma reported different adherence barriers to inhaled medicines. Independent adherence barriers (odds ratio [95% confidence interval]) to inhaled medicines relative to those for oral medicines among patients with COPD and asthma were those related to item Q8 ( "I know if I am reaching my health goals"; 2.49 [1.39-4.47]; p=0.0022) and item Q2 ( "I run out of my medicine because I do not get refills on time"; 2.69 [1.26-5.75]; p=0.0127), respectively. Among patients with poor adherence to only inhaled medicines, those with COPD and asthma recognized item Q3 ( "consuming alcohol and taking medicines"; 6.63 [1.27-34.7]; p<0.05) and item Q1 ( "forget to take medicines only sometimes"; 4.29 [1.83-10.0]; p<0.05), respectively, were recognized as independent adherence barriers to inhaled medicines. The total ASK-20 scores and total barrier counts in patients with poor adherence to inhaled medicines were significantly higher than in those without poor adherence among patients with asthma (p=0.0057) but not those with COPD (p>0.05). Conclusion These results will aid in personalizing education on adherence to inhaled medicines among patients with COPD and asthma.