著者

Kazuki Fujikawa Kazuhiro Seki Kuniaki Uehara

雑誌

研究報告バイオ情報学(BIO)

巻号頁・発行日

vol.2013-BIO-34, no.12, pp.1-4, 2013-06-20

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More and more biomedical documents are digitally written and stored. To make the most of the rich resources, it is crucial to precisely locate the information pertinent to user's interests. An obstacle in finding information in natural language text is negations, which deny or reverse the meaning of a sentence. This is especially problematic in the biomedical domain since scientific findings and clinical records often contain negated expressions to state negative effects or the absence of symptoms. This paper reports on our work on a hybrid approach to negation identification combining statistical and heuristic approaches and describes an implementation of the approach, named NegFinder, as a Web service.

著者

大野 亮仁 藤 博幸 山名 早人

雑誌

研究報告バイオ情報学(BIO)

巻号頁・発行日

vol.2013-BIO-34, no.11, pp.1-7, 2013-06-20

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G タンパク共役受容体 (G-protein-coupled receptor,以下 GPCR) は,内在性リガンドと結合することで細胞外からの様々なシグナルを細胞内に伝達しており,新薬開発の重要なターゲットとして注目されている.しかし,GPCR と化合物の組合せは膨大であるため,計算機による正確な結合予測手法が求められている.先行研究として,GPCR を構成するアミノ酸配列全長が持つ化学的性質と化合物の化学的性質を用いて結合を予測する手法がある.しかし,GPCR には立体構造が既知のものがあり,その細胞外側の領域にリガンド結合部位が決まっている.よって,リガンド結合部位のアミノ酸が結合に強く影響を与えると考えたため,リガンド結合部位のアミノ酸に注目すべきと考えた.本研究では,全長配列を使用する代わりに,リガンド結合部位のアミノ酸のみを利用することで予測の改善を試みた.特徴量として結合部分のアミノ酸と化合物の化学記述子を用い,SVM により GPCR と化合物の結合を予測したところ,アミノ酸配列全長を用いた時に比べ Accuracy が 3.6%,F 値は 0.038,AUC は 0.002 向上した.

著者

桑沢 清明 松村 伸治 矢沢 徹

出版者

東京都立大学

雑誌

基盤研究(B)

巻号頁・発行日

1996

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有爪動物(Onychophora)カギムシperipatusは環形動物と節足動物をつなぐ幻の動物の近縁動物とも考えられていて、系統進化上で貴重な動物群である。このため比較生理学、神経生物学上興味がもたれる動物であるが、現在までのところほとんど研究されない。本研究では心臓とその神経支配について、主として、すでに調べられてきた周辺の動物群である甲殻類、昆虫類、環形動物、軟体動物との関係のなかで研究を進めることを目的とした。カギムシをオーストラリアに求め、Euperipatoides kanangrensisを取得して研究室で飼育管理し研究に用いた。神経伝達物質または神経修飾物質の面から中枢及び末梢のニューロン構成を明らかにして、ニューロンのマッピングを行うため各種推定伝達物質の抗体を用いて免疫細胞化学的に研究を行った。1. 中枢神経系は左右の脳神経節球とそれぞれに続く腹神経索および多数の腹神経索横連合神経からなる。全神経系に亘ってFMRFamide様免疫陽性細胞やそのプロセスを検出した。心臓神経、腸管にも免疫陽性プロセスが認められた。脳神経節中では横連合中に、特に多くの免疫陽性ニューロンが存在した。腸管にも免疫陽性ニューロンの存在が認められた。本研究により有爪動物にFMRFamide様物質が存在するこという最初の知見がえられたことになる。2. 神経系全般に亘りセロトニン様免疫陽性ニューロンプロセスが観察された。脳神経節では横連合に陽性プロセスを多く認め、その近くの領域にニューロン細胞体が多く認められた。アンテナには陽性プロセスが認められなかったが、基部の脳糸球体構造に陽性プロセスが観察された。視索には認められなかったが、網膜および視神経節に免疫陽性プロセスが認められた。心臓、輸卵管に免疫陽性プロセスが認められた。これらのことから、セロトニンは感覚、運動神経で神経伝達物質として使われていると推測された。

著者

Yuuichi Nakano Mitsuo Iwadate Hideaki Umeyama Y-H.Taguchi

雑誌

研究報告バイオ情報学(BIO)

巻号頁・発行日

vol.2013-BIO-34, no.10, pp.1-8, 2013-06-20

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Type III secretion system (T3SS) effector protein is a part of bacterial secretion systems. T3SS exists in the pathogenic and symbiotic bacteria. How the T3SS effector proteins in these two classes differ from each other should be interesting. In this paper, we proposed the usage of principal component analysis based linear discriminant analysis that discriminates T3SS effector proteins between plant pathogenic, animal pathogenic and plant symbiotic bacteria by the accuracy of 0.77. We also hypothesized that the feature vector proposed by Yahara et al represents protein structure, possibly protein folds defined in Structural Classification of Proteins (SCOP) database.

著者

大羽成征 中江健 吉本潤一郎

雑誌

研究報告バイオ情報学(BIO)

巻号頁・発行日

vol.2013-BIO-34, no.9, pp.1-5, 2013-06-20

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スパイク統計に基づいて神経細胞間の機能的結合を知るための手法として、一般化線形モデル (GLM) に基づく応答関数推定法が提案されている。GLM によれば古典的な 2 ニューロン間クロスコレログラム解析で生じる擬似相関起源の偽陽性を排除できる。しかし、GLM によっても原理的に避けられない偽陽性要因が存在する。本発表ではそのうち 2 つを指摘する。第一は、スパイク検出時刻決定の誤差、第二は時間方向に非線形性の強いダイナミクスを GLM でフィッティングすることによって生じる歪みである。本発表ではまた、これらの偽陽性を避けるために、応答関数可視化法に関する小さなトリック 「GLM クロスコレログラム」 を提案する。これとクラスタリング法と組み合わせて、機能的結合パターンの典型例を見つけることで、通常手法を使った場合に導かれたであろう解釈誤りの可能性を減らせることを示す。

著者

豊田 雄彦 鈴木 美香 石嶺 ちづる

出版者

自由が丘産能短期大学

雑誌

基盤研究(C)

巻号頁・発行日

2010

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本研究は就職活動体験を綴った「就職活動体験記」を通じた交流を通して、学生の働くことへのリアリティの醸成を目指し、そのポートフォリオの解析を通してキャリア教育プログラムの開発、改善を行おうとするものである。「就職活動体験記」およびその読者による「受け止め」の記述内容をテキストマイニングの手法を用いて分析することにより、「就職活動体験記」の記述およびその記述内容を通じた交流の効果を測定した。その結果、経済、雇用情勢の厳しい時期の就職活動体験は、自らの職業観・勤労観におよぼす変化が顕著に見られること。体験記の読者は就職活動の早期のイベントに興味を示す傾向があること。また早期に活動すべきと考えた読者は実際に早期に就職活動を開始する傾向があること。適切な授業プログラムの実施により、失敗体験を下級生に伝承し、下級生の就職活動に資することができることを確認できた。

著者

舘野 太朗

出版者

筑波大学大学院地域研究研究科

雑誌

筑波大学地域研究 (ISSN:09121412)

巻号頁・発行日

no.34, pp.181-202, 2013-03-31

著者

Nemoto Yuya Hino Ken-ichi Maeshima Nobuya

出版者

American Physical Society

雑誌

Physical review B (ISSN:10980121)

巻号頁・発行日

vol.87, no.20, pp.205305, 2013-05

被引用文献数

5

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We examine a continuum effect of a dynamic Wannier-Stark ladder (DWSL) driven by a cw laser—with Fac and ω as amplitude and frequency, respectively—by means of an excess density of states (DOS), ρ(ex)(E), closely related to the more familiar DOS and proportional to the lifetime of a resonance state. It is mathematically shown that ρ(ex)(E) is governed by three different physical mechanisms: the single-channel resonance mechanism, the multichannel nonresonance mechanism, and the multichannel resonance mechanism. The last mechanism becomes more important with the increase in Fac. The effect of the interchannel interaction is maximized when the ratio of a Bloch frequency to ω, represented as η, equals unity. In the actual calculations based on the R-matrix Floquet theory, it is revealed that, in a large-Fac region, ρ(ex)(E) for η=1 shows a complicated spectral structure composed of a couple of newly growing peaks, in contrast to ρ(ex)(E) for η=3 which just shows a monotonic change of a single spectral peak. It is speculated that the pronounced feature of the former spectra is attributed to the Fano-like multichannel resonance mechanism, whereas the feature of the latter case is attributed to the multichannel nonresonance mechanism.

著者

Toko Kaoru Fukata Naoki Nakazawa Koki Kurosawa Masashi Usami Noritaka Miyao Masanobu Suemasu Takashi

出版者

Elsevier B.V.

雑誌

Journal of crystal growth (ISSN:00220248)

巻号頁・発行日

vol.372, pp.189-192, 2013-06

被引用文献数

15 4

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High-quality crystalline Ge thin films on low-cost glass substrates are desired to reduce the fabrication cost of high-efficiency tandem solar cells. We applied an Al-induced crystallization technique to amorphous-Ge films (50-nm thickness) on SiO2 glass substrates. The annealing temperature of the sample strongly influenced the grain size and the crystal orientation in the grown polycrystalline Ge layers: low annealing temperatures resulted in large grains and high (111)-orientation fractions. As a result, annealing at 325 °C provided 98% (111)-oriented grains with average diameters of 30 μm. Moreover, the grown Ge layers could be used as an epitaxial template for chemical vapor deposition. This large-grained Ge film on a SiO2 substrate appears promising for use as a Ge light-absorbing layer, as well as an epitaxial buffer layer for group III–V compound semiconductors.

著者

岩永 青史

巻号頁・発行日

2012

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筑波大学博士 (農学) 学位論文・平成24年5月31日授与 (甲第6284号)

著者

谷口 仁士 飯田 汲事

出版者

愛知工業大学

雑誌

愛知工業大学研究報告. B, 専門関係論文集 (ISSN:03870812)

巻号頁・発行日

vol.14, pp.207-217, 1979-03-31

被引用文献数

5

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昭和23年(1948)6月28日福井県にM=7.3の地震が発生し,福井,石川の両県に甚大な被害を及ぼした。この地震の被害資料の収集および解析を行ない,被害の全貌を明らかにし,全壊率分布,被害率分布等を詳細に求めた。また被害率と全壊率との関係も明らかにした。特に断層からの距離と全壊率との関係を求めたところ,沖積層地盤では断層より約10kmまでの地域が全壊率30%以上の激震区域となっていることがわかった。さらに全壊率と半壊率との割合を調べたところ,全壊率が50%以上の地域においては,全壊家屋と半壊家屋を加えた大被害戸数が総戸数の9割近い値を示していることもわかった。なお震度分布を明らかにしたが,震度6以上の烈震区域の面積は約2,050km^2,震度7の激震区域の面積は約1,400km^2となり,如何に地震動の激烈地域が大きかったかがわかる。

著者

石田 定夫

出版者

明治大学政経資料センター

雑誌

資料センターニュース

巻号頁・発行日

vol.35, pp.28-29, 1986-02-25

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月日の流れは早いもので、宮下先生がお亡くなりになってはや1年経過した。一周忌の法要に参向して先生の遺影に接すると、いまにも先生が私たちに語らいかけておられるような気がする。宮下先生はビールやワインをこよなくたしなまれた。私はアルコール類には弱く、先生とまともにお相手をすることができなかったが、先生は私に無理に勧められることもなく、親しくお付き合いして下さった。私は、宮下先生のそういう包容力の大きい心の温かいお人柄を尊敬し、先生に兄事してきた。先生との最後のお付き合いは、昭和59年11月30日金曜日の夕方、先生が亡くなる2週間前のことで、忘れることのできない思い出となった。

著者

新 秀直

出版者

東京大学

雑誌

若手研究(B)

巻号頁・発行日

2010

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本研究の目的は充電池を医療機器に応用することで,電池廃棄物の削減等を図ることにある。本研究では,充電池管理システムの開発を行なった。また,実際に病棟で使用されている送信器で充電池を使用しその問題点を検証した。その結果,使用条件によって,大幅に連続作動時間が変わるため運用上注意が必要であることが示唆された。今後,医療機器の開発の側面からも充電池が安全に使用できるように検討することが必要である。

著者

塩澤 光一 神山 かおる 柳沢 慧二

出版者

特定非営利活動法人 日本咀嚼学会

雑誌

日本咀嚼学会雑誌 (ISSN:09178090)

巻号頁・発行日

vol.11, no.2, pp.117-121, 2002-03-30 (Released:2010-07-21)

参考文献数

10

被引用文献数

3

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咀嚼時の唾液分泌量の増加が嚥下誘発にどのような影響を与えるかを調べるために, 嚥下までの咀嚼回数と唾液分泌量について11名の成人被験者で調べた. 0.2M酒石酸 (酸刺激) およびコントロールとして蒸留水 (DW刺激) に浸けた濾紙片をそれぞれ被験者の舌背に1分間載せた後, グミ及びモチをそれぞれ嚥下まで咀嚼させた. 嚥下までの咀嚼回数はグミ咀嚼, モチ咀嚼どちらの場合でも, 酸刺激後の咀嚼の方がコントロール (DW刺激後) に比べて有意 (P<0.001) に減少したが, 嚥下までに分泌された唾液分泌量は, グミ咀嚼, モチ咀嚼どちらの場合でも有意な差は認められなかった. また, 嚥下直前の顎舌骨筋活動量は, 酸刺激後とコントロールとで有意な差は認められなかった. これらの結果から, 同じ食品を同一量咀嚼する場合には嚥下までに分泌される唾液分泌量は常に一定であることが示唆された.

著者

中村 好一

出版者

自治医科大学

雑誌

基盤研究(B)

巻号頁・発行日

2010

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心後遺症を持たない者も含めた川崎病既往者の追跡を行い、生命予後を明らかにする目的で、第8回~第12回川崎病全国調査(1982年7月~1992年12月)で52病院から報告された患者のうち、特定の要件を満たす6,576人について、戸籍を用いて2009年末日までの生存状況を確認し、死亡が判明した場合には死亡診断書に基づく死亡の解析を行った。全体でのSMRは1.00であったが、心後遺症を持つ者の急性期以降のSMRは1.86と有意に高かった。

著者

藤田 良治 山口 由衣 椎名 健

出版者

日本デザイン学会

雑誌

デザイン学研究 (ISSN:09108173)

巻号頁・発行日

vol.54, no.3, pp.1-8, 2007-09-30

参考文献数

8

被引用文献数

1

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本研究では撮影技法によって作られる映像の動きに着目し,映像素材におけるカメラムーブメントの違いが視聴者に与える心理的影響を明らかにする実験を行った.6種類のカメラムーブメント(ズームアップとズームバック,左パンと右パン,ティルトアップとティルトダウン)と4種類の情景カテゴリー(図形,自然,人工,人間)を組み合わせて24映像を製作した(6カメラムーブメント×4カテゴリー).この映像を,48名の被験者に呈示し印象評価を求めた.各項目の回答から5因子解(「好感度」「規則度」「活動度」「親和度」「インパクト度」)を得た.各因子の標準因子得点を用い.カメラムーブメント(6)×カテゴリー(4)の2要因分散分析を行った.その結果,それぞれのカメラムーブメントは視聴者に異なる心理的影響を与えることが明らかになり,視聴者に好感度やインパクトのある映像を製作するためには,撮影技法としてのカメラムーブメントを適切に選択することの重要性を示した.

著者

吉高 淳夫 尾崎昂 平嶋 宗

雑誌

情報処理学会論文誌 (ISSN:18827764)

巻号頁・発行日

vol.50, no.4, pp.1421-1430, 2009-04-15

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映像への効率良いアクセスを実現するためには映像の構造化が不可欠であり,また構造化を行うためにはカット検出だけでなくシーン境界検出等,相互に関係するショットをまとめる処理が必要である.映画やドラマにおいては,2種類の類似したショットが交互に繰り返される,ショット・リバースショットが会話の場面等で多用されるという特徴がある.ショット・リバースショットはカメラ操作をともなわない静的なショットから構成されることが比較的多いため,キーフレームの色領域に関する空間関係の類似度評価等,画像の静的特徴により検出するものが多かった.しかし,パン,チルト等のカメラ操作が施される場合もあり,そのような映像では全体が変化するために従来の静的な類似性判定では検出することは困難である.このようなショット区間の検出は映画のシーン境界検出やインデクシング,検索に必要であり,カメラワークを含むものも検出できることが精度向上のために望まれる.本論文ではカメラワーク成分をキャンセルする処理を施すことで一様な動きをした背景部分の除去を行い,残された主体部分の類似性判定に基づきショットどうしの類似性を判定することによって,カメラワークを含むショット・リバースショットの場面を抽出する手法を提案する.そして,カメラワークキャンセルを考慮しない従来検出法との比較により,提案手法の効果について評価した.

著者

Jeffrey M. Friedman

出版者

The Keio Journal of Medicine

雑誌

The Keio Journal of Medicine (ISSN:00229717)

巻号頁・発行日

vol.60, no.1, pp.1-9, 2011-03-25 (Released:2011-04-05)

参考文献数

69

被引用文献数

30 92

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The cloning of the ob gene and its gene product, leptin, has led to the elucidation of a robust physiologic system that maintains fat stores at a relatively constant level. Leptin is a peptide hormone secreted by adipose tissue in proportion to its mass. Recessive mutations in the leptin gene are associated with massive obesity in mice and humans, establishing a genetic basis for obesity. Leptin circulates in blood and acts on the brain to regulate food intake and energy expenditure. When fat mass falls, plasma leptin levels fall, stimulating appetite and suppressing energy expenditure until fat mass is restored. When fat mass increases, leptin levels increase, suppressing appetite until weight is lost. This system maintains homeostatic control of adipose tissue mass. The discovery of leptin has advanced our understanding of metabolic disease in a number of respects. Its identification has revealed a new endocrine system regulating body weight. This system provides a means by which changes in nutritional state regulate other physiologic systems. A number of leptin deficiency syndromes that are treatable with leptin replacement have been identified. The majority of obese subjects are leptin resistant, which establishes that obesity is the result of hormone resistance. Leptin treatment results in weight loss in a subset of obese patients and can also synergize with other anti-obesity agents to reduce weight in the general population. Leptin provides an entry point for studying a complex human behavior. Finally, this research has established that there is a powerful biological basis for obesity, a fact that is (correctly) changing public perception about the pathogenesis of this medical condition.

著者

Tjard R Schermer Winifred Malbon Robert Adams Michael Morgan Michael Smith Alan J Crockett

出版者

(公社)日本産業衛生学会

雑誌

Journal of Occupational Health (ISSN:13419145)

巻号頁・発行日

pp.12-0189-OA, (Released:2013-06-24)

被引用文献数

1 15

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Objectives: Previous studies in firefighters have been contradictory regarding their course of lung function over time. The aim of this ongoing study is to investigate how changes in lung function over time in male metropolitan firefighters compare with those in population controls, and to explore associations between firefighters’ use of personal respiratory protection devices during occupational exposures and their risk of accelerated lung function decline. Methods: A prospective comparison of FEV1 (forced expiratory volume in 1 second) and FVC (forced vital capacity) was performed between 281 firefighters and 933 population controls. Logistic regression models were used to compare changes from baseline of FEV1 and FVC after 3 years and risk of accelerated decline between the cohorts. Within the firefighter cohort, risk of accelerated decline was compared between subgroups based on use of respiratory protection devices. Results: Controls showed similar mean annual declines for FEV1 and FVC across age categories, whereas firefighters aged <45 years showed increasing values over time (p = 0.040). Firefighters had a lower odds of accelerated FEV1 decline compared with controls (OR = 0.60, 95%CI 0.44; 0.83), but firefighters who never or rarely used respiratory protection during fire knockdown had a higher odds of accelerated FEV1 decline compared with those who used it often or frequently (OR = 2.20, 95%CI 1.02; 4.74). Conclusions: Younger generations of firefighters showed an increase in lung function relative to older colleagues, while population controls consistently showed decline of lung function across all ages. Firefighters who reported to be incompliant in using respiratory protection showed an increased risk of accelerated FEV1 decline.

著者

山森 一人 堀口 進

出版者

一般社団法人電子情報通信学会

雑誌

電子情報通信学会論文誌. D-II, 情報・システム, II-情報処理 (ISSN:09151923)

巻号頁・発行日

vol.81, no.2, pp.370-377, 1998-02-25

被引用文献数

8

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ニューラルネットワークを用いた情報処理は制御やパターン認識などの分野で広く応用されている.しかし, 問題が大規模化するに従ってニューラルネットワークの学習に必要な時間が膨大になる.近年, 大規模ニューラルネットワークの学習を並列計算機を用いて高速化する研究が盛んに行われるようになった.しかしながら, これらの並列化手法は並列計算機のアーキテクチャに強く依存している場合が多く, 誤差逆伝搬学習法の並列化性能については十分に検討されていない.本論文では, 誤差逆伝搬法がもつ3種類の並列性を利用した並列学習モデルを解析し, その並列学習速度について詳しく検討する.これらの並列学習に関する解析結果を用いて実際の並列計算機上へ各モデルを実装して並列学習法の性能評価を行う.