著者
Shigenori Karasawa Keisuke Kawano Shin-ichi Fukaya Nobuo Tsurusaki
出版者
The Japanese Society of Systematic Zoology
雑誌
Species Diversity (ISSN:13421670)
巻号頁・発行日
vol.25, no.1, pp.89-102, 2020-02-15 (Released:2020-02-15)
参考文献数
69

Three forms of Japanese Eudigraphis (Penicillata, Polyxenidae), which have long been treated as subspecies of Eudigraphis takakuwai (Miyosi, 1947), i.e., E. t. takakuwai (Miyosi, 1947), E. t. nigricans (Miyosi, 1947), and E. t. kinutensis (Haga, 1950), are raised here to three distinct species. Overlap of their distributional ranges over wide areas of Japan was confirmed, and molecular phylogeny using both nuclear (ITS2) and mitochondrial (COI) DNA testified monophyly of each of the three forms. Additionally, the three forms can be easily distinguished from one another by body size, coloration, and habitat, though species identification for the specimens preserved in ethanol is often difficult due to their morphological similarity other than coloration and size. Description of some so-far neglected morphological characters were provided with some SEM photos to supplement knowledge on taxonomy and morphology of the family.
著者
Kuei-Chiu Chen Hin-Kiu Mok
出版者
The Ichthyological Society of Japan
雑誌
魚類学雑誌 (ISSN:00215090)
巻号頁・発行日
vol.35, no.1, pp.90-97, 1988-05-25 (Released:2010-06-28)
参考文献数
9

クマノミとハマクマノミの水槽内での発音を記録し, 両種の違いを比較した.pop-chirp発音は優越個体のみにみられ, 咽頭歯をすりあわせることにより発生する.クマノミ類の発音する種類は, 発音しない種類に比べ, ceratobranchial plateと2nd to 4th pharyngobran-chialsに長い犬歯をもっている.クマノミの従属個体は, 体を間断なく動かしながら, 優越個体に対し, 別種の音 (shaking sound) を出す.この音は流体力学的なものであろう.
著者
Ken-ichiro KAMEYAMA Tatsuya NISHI Manabu YAMADA Kentaro MASUJIN Kazuki MORIOKA Takehiro KOKUHO Katsuhiko FUKAI
出版者
JAPANESE SOCIETY OF VETERINARY SCIENCE
雑誌
Journal of Veterinary Medical Science (ISSN:09167250)
巻号頁・発行日
pp.19-0133, (Released:2019-07-09)
被引用文献数
32

Following an outbreak of classical swine fever (CSF) in Japan, 2018, CSFV JPN/1/2018 was isolated from an infected pig sample. In this study, we carried out a comparative experimental infection in pigs using this strain and the highly virulent ALD strain and compared outcomes, including clinical manifestation, virus shedding patterns and antibody responses. Although pigs inoculated orally or intramuscularly with JPN/1/2018 developed hyperthermia and had decreased leucocyte numbers, they survived for the whole experimental period and showed less severe clinical signs than those infected with the ALD strain. We confirmed the presence of characteristic multifocal infarction of the margin of the spleen that arises following infection with JPN/1/2018, albeit that this finding was not observed in all infected pigs. Both viruses efficiently spread to contact pigs in a similar manner, suggesting in transmissibility between the two strains. Viral RNAs were detected in all clinical samples, especially whole blood samples, before the pigs developed hyperthermia until at least approximately 2 weeks after inoculation. Our findings will be valuable for the investigations into epidemic events occurring in Japan and for establishing diagnostic strategies and control measures against CSF.
著者
Avril H. Underwood Ilka Straehler-Pohl Teresa J. Carrette Jessica Sleeman Jamie E. Seymour
出版者
The Plankton Society of Japan, The Japanese Association of Benthology
雑誌
Plankton and Benthos Research (ISSN:18808247)
巻号頁・発行日
vol.13, no.4, pp.143-153, 2018-11-21 (Released:2018-11-14)
参考文献数
71
被引用文献数
4

This research presents the early life history stages of Malo maxima, a recently described tropical Australian cubozoan from the family Carukiidae, from sexual fertilisation to metamorphosis including planula, polyp, asexual reproductive strategies and young medusa. We discuss the similarities between M. maxima and two closely related carukiid species from Japan and Australia including morphology and behaviours previously undocumented in the class Cubozoa. All three carukiids can reproduce by mono-disk strobilation, a strategy common to all other orders of the class Scyphozoa but only recently described in Cubozoa.
著者
Takuya MAKI Miho INOUE-MURAYAMA Kyung-Won HONG Eiji INOUE Masami MAEJIMA Norio KANSAKU Yuichi TANABE Shin'ichi ITO
出版者
Japanese Society of Animal Breeding and Genetics
雑誌
The Journal of Animal Genetics (ISSN:13459961)
巻号頁・発行日
vol.36, no.2, pp.95-104, 2008-12-01 (Released:2010-03-18)
参考文献数
20
被引用文献数
1 1

日本犬標準6品種 (柴犬、紀州犬、四国犬、北海道犬、甲斐犬、秋田犬) の中で、柴犬は飼育数も多く最も馴染み深い。柴犬には、信州柴犬 (日保系・柴保系) 、山陰柴犬、美濃柴犬の3内種が存在し、形態や性格が異なる。先行する日本犬研究の多くは、柴犬の3内種を区分けしないで扱ってきたため、各内種内の遺伝的多様性や、内種間の遺伝的分化の程度は明らかでない。本研究では、柴犬3内種 (信州柴犬/日保系、信州柴犬/柴保系、山陰柴犬、美濃柴犬の4集団) に、比較として加えた7品種 (北海道犬、秋田犬、四国犬、薩摩犬、琉球犬、日本スピッツ、ラブラドール・レトリーバーの7集団) の計11集団、合計430頭に対して、マイクロサテライト17座位を用いて、解析した。用いた17座位による柴犬3内種 (4集団) の期待ヘテロ接合度の平均は、信州柴犬/日保系が0.641、信州柴犬/柴保系が0.480、山陰柴犬が0.508、美濃柴犬が0.588であり、他の7犬種の平均0.603と、大きく異ならない値を示した。また、柴犬3内種 (4集団) 問の遺伝的分化の程度は高度に有意であった (P<0.Ol) 。11集団間の枝分れ図では、柴犬の3内種 (4集団) は相互に近い位置関係を示したが、山陰柴犬は、他の2内種 (3集団) からはやや離れた位置関係にあった。この結果から、山陰柴犬は、信州柴犬 (日保系・柴保系) や美濃柴犬と異なる可能性が考えられた。また、柴犬3内種 (4集団) に属する個体問の枝分れ図では、個々の内種内は遺伝的に密にまとまっており、 (社) 日本犬保存会【日保】と天然記念物柴犬保存会【柴保】両系の問にも明確な差が認められた。このことから、各内種を保存・育成する会で、独自に血統が保持されてきたことが示唆された。今回の結果から、柴犬3内種 (4集団) 問は統計的に高度に有意な遺伝的分化を示しており、今後の研究では、柴犬は3内種 (4集団) 別に区分けして取り扱う必要がある、と考えられる。
著者
安藤 元一 上遠 岳彦 川嶋 舟 Motokazu Ando Kamito Takehiko Kawashima Shu 東京農業大学農学部バイオセラピー学科 国際基督教大学生命科学デパートメント 東京農業大学農学部バイオセラピー学科 Department of Human and Animal-Plant Relationships Faculty of Agriculture Tokyo University of Agriculture Department of Life Science International Christian University Department of Human and Animal-Plant Relationships Faculty of Agriculture Tokyo University of Agriculture
巻号頁・発行日
vol.57, no.4, pp.275-286,

学生が大学入学前にどのような野生動物関連の知識と体験を有しているか,東京農大生を対象に2002年と2012年にアンケート調査した。野外で見たことのある動物は2002年には鳥類>哺乳類>魚類>爬虫類>両生類の順であったが,2012年には爬虫類,両生類,魚類が大きく減少した。後者は水辺などに行かねば見られない動物であることから,この10年間に若年層の自然に触れる機会が減少していると思われた。野生動物に関する知識や意識における10年間の変化は少なかった。野生動物の目撃場所では,自宅周辺や里山が多く,旅行中の目撃頻度は減少傾向にあった。学生がイメージできる野生動物関連職業の数は少なく,動物園や研究職など一部職種に集中していた。好きな日本産動物の上位は陸生の中・大型哺乳類で占められ,食虫目や翼手目への関心は極めて低かった。好きな世界の動物では動物園で見ることのできるライオン,パンダ,ゾウ,コアラ,トラなどの大型獣が上位であった。野生動物に関する情報源としては特定のテレビ番組が大きな役割を果たしており,本では動物図鑑がよく利用されていた。動物系学科で学ぶ学生(東京農業大学)と非動物系の学生(国際基督教大学)を比較すると,野生動物教育の経験を除いて,アンケート結果は類似しており,入学前における野生動物経験の多寡は大学選択に影響していなかった。動物系の異なる研究室(野生動物学と動物介在療法)に所属する学生の野生動物経験を比較したところ,回答傾向は概ね類似したが,後者では鳥類や獣害に対する関心が若干低かった。
著者
Yusuke Okazaki Tuyen Thi Nguyen Arisa Nishihara Hisashi Endo Hiroyuki Ogata Shin-ichi Nakano Hideyuki Tamaki
出版者
Japanese Society of Microbial Ecology / Japanese Society of Soil Microbiology / Taiwan Society of Microbial Ecology / Japanese Society of Plant Microbe Interactions / Japanese Society for Extremophiles
雑誌
Microbes and Environments (ISSN:13426311)
巻号頁・発行日
vol.38, no.1, pp.ME22102, 2023 (Released:2023-03-15)
参考文献数
20
被引用文献数
1

We herein propose a fast and easy DNA and RNA co-extraction method for environmental microbial samples. It combines bead beating and phenol-chloroform phase separation followed by the separation and purification of DNA and RNA using the Qiagen AllPrep DNA/RNA mini kit. With a handling time of ~3 h, our method simultaneously extracted high-quality DNA (peak size >10–15‍ ‍kb) and RNA (RNA integrity number >6) from lake bacterioplankton filtered samples. The method is also applicable to low-biomass samples (expected DNA or RNA yield <50‍ ‍ng) and eukaryotic microbial samples, providing an easy option for more versatile eco-genomic applications.
著者
Kinoshita Chiken Nakai Kiyomichi Fukumoto Ken-ichi Kutsuwada Masanori Nogita Kazuhiro
出版者
Tohoku University
雑誌
Science reports of the Research Institutes, Tohoku University. Ser. A, Physics, chemistry and metallurgy (ISSN:00408808)
巻号頁・発行日
vol.35, no.2, pp.417-425, 1991-03-05

The cascade damage and its kinetic behavior in various kinds of ceramics irradiated with fission- and fusion-neutrons have been examined through transmission electron microscopy. Fission- and fusion-neutrons introduce relatively dilute concentration of point defects around primary knock-on atoms through the displacement cascade process in low-Z ceramics. Higher concentration of point defects, which induces the contrast corresponding to the cascade damage though TEM, is induced only in covalent crystals consisting of relatively high-Z elements. The nucleation and growth process of interstitialloops is strongly affected by the crystal structure and structural vacancy.
著者
Eun Seo Jo Mark Algee-Hewitt
出版者
Japanese Association for Digital Humanities
雑誌
Journal of the Japanese Association for Digital Humanities (ISSN:21887276)
巻号頁・発行日
vol.3, no.1, pp.1-32, 2018-10-21 (Released:2018-10-22)
参考文献数
21

Historians have traditionally relied on close readings of select primary sources to evaluate linguistic and discursive changes over time, but this approach can be limiting in its scope. Numeric representations of language allow us to statistically quantify and compare the significance of discursive changes and capture linguistic relationships over time. Here, we compare two deep learning methods of quantitatively identifying the chronology of linguistic shifts: RNN classification and RNN language modeling. In particular, we examine deep learning methods of isolating stylistic from topical changes, generating “decade embeddings,” and charting the changing average perplexity in a language model trained on chronologically sorted data. We apply these models to a historical diplomatic corpus, finding that the two world wars proved to be notable moments of linguistic change in American foreign relations. With this example we show applications of text-based deep learning methods for digital humanities usages.
著者
CODATA-ICSTI Task Group on Data Citation Standards and Practices
出版者
CODATA
雑誌
Data Science Journal (ISSN:16831470)
巻号頁・発行日
pp.OSOM13-043, (Released:2013-09-08)
参考文献数
185
被引用文献数
56

The use of published digital data, like the use of digitally published literature, depends upon the ability to identify, authenticate, locate, access, and interpret them. Data citations provide necessary support for these functions, as well as other functions such as attribution of credit and establishment of provenance. References to data, however, present challenges not encountered in references to literature. For example, how can one specify a particular subset of data in the absence of familiar conventions such as page numbers or chapters? The traditions and good practices for maintaining the scholarly record by proper references to a work are well established and understood in regard to journal articles and other literature, but attributing credit by bibliographic references to data are not yet so broadly implemented. This report discusses the current state of data citation practices, its supporting infrastructure, challenges to implementation of good data citation practices, and open research questions.
著者
中村 和昭 諫田 泰成 山崎 大樹 片岡 健 青井 貴之 中川 誠人 藤井 万紀子 阿久津 英憲 末盛 博文 浅香 勲 中村 幸夫 小島 肇 伊藤 弓弦 関野 祐子 古江-楠田 美保
出版者
日本組織培養学会
雑誌
組織培養研究 (ISSN:09123636)
巻号頁・発行日
vol.37, no.2, pp.123-131, 2018 (Released:2018-09-08)
参考文献数
4

近年、細胞培養に関連する技術の急速な開発に伴い、創薬研究、再生医療への応用など、細胞培養が貢献する分野が拡大している。培養細胞を利用する上において重要な点の一つとして、適切な状態の細胞を用いることが挙げられる。そのためには、使用する細胞の状態を把握することが重要である。その手段として、生きている細胞を非侵襲的に観察できる倒立位相差顕微鏡が汎用されている。倒立位相差顕微鏡による観察から得られるのは形態情報や細胞密度のみではあるものの、その観察は培養細胞を用いた実験の信頼性と再現性を担保するために有用な手段である。生きている細胞の観察の手法には様々な留意点がある。そこで、細胞培養の観察における基本概念を共有すべきと考え、「細胞培養の観察の基本原則」案を作成した。本基本原則案は、顕微鏡観察に先立つ細胞の目視、低倍率・高倍率での倒立位相差顕微鏡観察、観察のタイミング、適切な記録と保存などに関して7条項から構成されている。この基本原則の概念が共有され、細胞培養技術を用いた研究の信頼性が向上することを期待する。
著者
江頭 勇紀 渡邊 亮 吉田 穂波 鄭 雄一 西海 昇 Byung-Kwang YOO
出版者
日本公衆衛生学会
雑誌
日本公衆衛生雑誌 (ISSN:05461766)
巻号頁・発行日
pp.22-039, (Released:2022-11-28)
参考文献数
27

目的 COVID-19の感染流行に伴うまん延防止措置法等の適用に際し,都道府県は科学的根拠に基づいた政策立案を求められたが,国の支援と都道府県の政策需要の乖離が課題であった。そのため,神奈川県立保健福祉大学と神奈川県庁は,共同でEBPM(Evidence Based Policy Making)プロジェクトを立ち上げ,COVID-19感染予測モデルを開発し,政策判断へ活用した。そこで,本事例の成果および課題を検討し,今後の公衆衛生行政への示唆を提示する。方法 Google社が開発した新型コロナウイルス感染者予測モデル『COVID-19感染予測(日本版)』(Google AI)の推計と公開データを組み合わせた「簡易モデル」,二次医療圏の日別データを使用した「主要モデル」を開発した。主要モデルの開発では,神奈川県庁内で散逸したデータを統合データプラットフォームに格納し,二次医療圏ごとに療養者,入院者,重症者を予測した。予測は,パネルデータ推計にGoogle AIの推計を外挿することで,新規感染者数のピーク値を反映させた。活動内容 約50種類のデータを統合データプラットフォームに格納し,神奈川県立保健福祉大学の学術チームによる,データの質の評価後,使用データを選定した。推計結果は,平均絶対パーセント誤差(MAPE),平均二乗誤差の平方根(RMSE),平均二乗対数誤差(RMSLE)により評価した。主要モデルで最も精度が高かったのは,2021年9月5日を基準日としたモデルであった。結論 統合データプラットフォームを用いて二次医療圏の日別データを用いることで,高い精度で予測できたため,政策判断の際に活用された。官学連携の際,専門家とともに,行政側の意思決定プロセスに精通した者をアカデミア側に参画させることにより,円滑な連携が行えることがわかった。一方,諸外国と比較し,本邦では,公開データの粒度の粗さ,限定された研究主体,継続的な予測モデルの開発が課題であることが明らかとなった。
著者
妖 -AYA-
出版者
人工知能学会
雑誌
人工知能学会全国大会論文集 (ISSN:13479881)
巻号頁・発行日
vol.28, 2014

マジックには種も仕掛けもございませんが、実演&おしゃべりを通してその秘密の一端に皆様をご案内できれば幸いでございます。
著者
HIDEAKI KANZAWA-KIRIYAMA AIKO SASO GEN SUWA NARUYA SAITOU
出版者
The Anthropological Society of Nippon
雑誌
Anthropological Science (ISSN:09187960)
巻号頁・発行日
vol.121, no.2, pp.89-103, 2013 (Released:2013-08-27)
参考文献数
55
被引用文献数
18 23

We investigated mitochondrial DNA haplogroups of four Jomon individuals from the Sanganji shell mound in Fukushima, Tohoku district, Japan. Partial nucleotide sequences of the coding and control region of mitochondrial DNA were determined. The success rate of sequencing increased when we analyzed short DNA sequences. We identified haplogroups from all four samples that were analyzed; haplogroup frequencies were 50% (n = 2) for N9b and 50% (n = 2) for M7a2. Haplogroup N9b has been previously observed in high frequencies in the other Tohoku Jomon, Hokkaido Jomon, Okhotsk, and Ainu peoples, whereas its frequency was reported to be low in the Kanto Jomon and the modern mainland Japanese. Sub-haplogroup M7a2 has previously been reported in the Hokkaido Jomon, Okhotsk, and modern Udegey (southern Siberia) peoples, but not in the Kanto Jomon, Ainu, or Ryukyuan peoples. Principal component analysis and phylogenetic network analysis revealed that, based on haplogroup frequencies, the Tohoku Jomon was genetically closer to the Hokkaido Jomon and Udegey people, than to the Kanto Jomon or mainland modern Japanese. The available evidence suggests genetic differences between the Tohoku and Kanto regions in the Jomon period, and greater genetic similarity between the Tohoku Jomon and the other investigated ancient (Hokkaido Jomon, Okhotsk) and modern (Siberian, Udegey in particular) populations. At the same time, the Tohoku and Hokkaido Jomon seem to differ in sub-haplotype representations, suggesting complexity in Jomon population structure and history.